| Texto completo | |
| Autor(es): |
Marquez, Roberto
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Machado, Denis Jacob
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Nouri, Reyhaneh
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Gendreau, Kerry L.
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Janies, Daniel
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Saporito, Ralph A.
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Kronforst, Marcus R.
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Grant, Taran
Número total de Autores: 8
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | GIGABYTE; v. 2025, p. 16-pg., 2025-06-20. |
| Resumo | |
Dendrobatid poison frogs have become well established as model systems in several fields of biology. Nevertheless, the development of molecular and genetic resources for these frogs has been hindered by their large, highly repetitive genomes, which have proven difficult to assemble. Here we present a draft assembly for Phyllobates terribilis (12.6 Gb), generated using a combination of sequencing platforms and bioinformatic approaches. Similar to other poison frog sequencing efforts, we recovered a highly fragmented assembly, likely due to the genome's large size and very high repeat content, which we estimated to be approximate to 88%. Despite the assembly's low contiguity, we were able to annotate multiple members of three gene sets of interest (voltage-gated sodium channels and Notch and Wnt signaling pathways), demonstrating the usefulness of our assembly to the amphibian research community. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 15/18654-2 - Sequenciamento genômico do sapo pé-de-pá-oriental, Scaphiopus holbrookii (Amphibia: Anura: Scaphiopodidade) e do sapo flamenguinho, Melanophryniscus moreirae (Amphibia: Anura: Bufonidae) |
| Beneficiário: | Denis Jacob Machado |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |
| Processo FAPESP: | 18/15425-0 - Uma abordagem multidisciplinar para o estudo da diversificação dos anfíbios: fase 2 |
| Beneficiário: | Taran Grant |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores - Fase 2 |
| Processo FAPESP: | 12/10000-5 - Uma abordagem multidisciplinar para o estudo da diversificação de anfíbios |
| Beneficiário: | Taran Grant |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores |
| Processo FAPESP: | 13/05958-8 - Genômica Comparada e a Evolução da Defesa Química em Anfíbios |
| Beneficiário: | Denis Jacob Machado |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |