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Espadaa, Caroline R. ; Anthonb, Christian ; Magalhaesa, Rubens D. M. ; Junior, Jose Carlos Quilles ; Teles, Natalia M. M. ; Pais, Fabiano S. ; Orsine, Lissur A. ; de Almeida, Leticia ; Defina, Tania P. A. ; Dowle, Adam ; Gorodkin, Jan ; Walrad, Pegine B. ; Cruz, Angela K.

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: NON-CODING RNA RESEARCH; v. 14, p. 14-pg., 2025-10-01.

Resumo

Leishmania parasites alternate between hosts, facing environmental changes that demand rapid gene expression adaptation. Lacking canonical RNA polymerase II promoters, transcription in these eukaryotes is polycistronic, with gene regulation occurring post-transcriptionally. Although non-coding RNAs (ncRNAs) have been identified in Leishmania transcriptomes, their functions remain unclear. Recognizing RNA structure's importance, we performed a genome-wide alignment of L. braziliensis and related species, identifying conserved RNA structures, 38 of which overlap with known ncRNAs. One such ncRNA, lncRNA45, was functionally characterized. Using a knockout cell line, we demonstrated that lncRNA45 is crucial for parasite fitness. Reintroducing the wild type lncRNA45 restored fitness, while a version with a single nucleotide substitution in the structured region did not. This mutation also altered RNA-protein interactions. These findings suggest that lncRNA45's regulatory role and protein interactions rely on its secondary structure. This study highlights the significance of structured lncRNAs in Leishmania biology and their potential as therapeutic targets. Further research into these ncRNAs could uncover new parasite regulation mechanisms and inspire novel treatment strategies. (AU)

• Processo FAPESP: 21/15182-3 - Monitoramento, localização e função de ncRNA diferencialmente expressos em Leishmania braziliensis por RNA FISH multi-color a nível subcelular
• Beneficiário: José Carlos Quilles Junior
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 20/00087-2 - Validação funcional de poteciais non-coding RNAs diferenciamente expressos durante o ciclo de vida de Leishmania viannia braziliensis
• Beneficiário: Caroline Ricce Espada
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 21/10043-5 - Análises computacionais comparativas de transcriptomas e identificação, em larga escala, de interações entre proteínas ligantes de RNA e ncRNAs e proteínas de reparo/recombinação e DNA
• Beneficiário: Lissur Azevedo Orsine
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Processo FAPESP: 17/19040-3 - Utilização de high-content screening para avaliar da atividade leishmanicida de drogas em macrófagos
• Beneficiário: Leticia de Almeida
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 15/13618-8 - Regulando trans-reguladores: investigação da via molecular de PRMT7 como regulador epigenético da virulência em Leishmania
• Beneficiário: Angela Kaysel Cruz
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 22/10270-4 - Investigação de interações RNA não-codificante-proteína em Leishmania (Viannia) braziliensis: identificando ligantes e avaliando os perfis de interação.
• Beneficiário: Caroline Ricce Espada
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 23/18057-0 - Investigação do papel da Argonauta na infecção por Leishmania braziliensis
• Beneficiário: Lissur Azevedo Orsine
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 19/18607-5 - Identificação computacional e caracterização estrutural de RNA não codificadores em Leishmania braziliensis
• Beneficiário: Rubens Daniel Miserani Magalhães
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 20/00088-9 - Regulação epigenética da expressão gênica em Leishmania
• Beneficiário: José Carlos Quilles Junior
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 18/14398-0 - Centro Reino-Unido-Brasil para o Estudo da Leishmaniose (JCPiL)
• Beneficiário: Angela Kaysel Cruz
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático