msechBari, a new MITE-like element in Drosophila sechellia related to the Bari transposon

Autor(es)

Dias, Elaine Silva ^[1] ; Aparecida Carareto, Claudia Marcia ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] UNESP Sao Paulo State Univ, Dept Biol, Sao Paulo - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: GENETICS RESEARCH; v. 93, n. 6, p. 381-385, DEC 2011.
• Citações Web of Science: 6

Resumo

A few occurrences of miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) have been reported in species of the genus Drosophila. Here, we describe msechBari, a MITE-like element in Drosophila sechellia. The element is short, approximately 90 bp in length, AT-rich and occurs in association with, or close to, genes, characteristics that are typical for MITEs. The identification was performed in silico using the sequenced genome of D. sechellia and confirmed in a laboratory strain. This short element is related to the Bari\_DM transposon of Drosophila melanogaster, having terminal inverted repeats (TIRs) of a similar length and a high identity with the full-length Bari\_DM element. The estimated recent origin of the element and the homogeneity observed between copies found in the genome suggests that msechBari could be active in D. sechellia. (AU)

• Processo FAPESP: 08/07629-3 - Proposição dos modelos de expansão intragenômica dos elementos transponíveis 412, F e Bari em Drosophila melanogaster e D. simulans e análise de fatores que possam interferir na dinâmica de transposição
• Beneficiário: Elaine Silva Dias
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 10/10731-4 - Dinâmica evolutiva e regulação de elementos de transposição em populações e espécies de Drosophila
• Beneficiário: Claudia Marcia Aparecida Carareto
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular