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Análise funcional de cromossomos B, utilizando o peixe ciclídeo Astatotilapia latifasciata como modelo

Processo:13/04533-3
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2013
Data de Término da vigência: 30 de junho de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:César Martins
Beneficiário:César Martins
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:Botucatu
Pesquisadores associados:Guilherme Targino Valente
Assunto(s):Citogenética molecular  Peixes  Genômica  Cromossomos B  Genoma mitocondrial 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:cromossomos | Cromossomos B | Evolução | Genômica | Genômica Funcional | citogenômica

Resumo

Os cromossomos supernumerários (também chamados de cromossomos B) são elementos extras, não homólogos ao complemento A e encontram-se presentes em aproximadamente 15% das espécies de eucariotos. O papel funcional deste cromossomo encontra-se ainda em pleno debate, sendo sua presença e manutenção nos organismos justificada principalmente devido ao seu potencial parasítico. Os estudos em cromossomos B tem sido essencialmente conduzidos em nível citogenético, sendo que abordagens genômicas em larga escala tem sido pouco exploradas. Análises genéticas prévias envolvendo sequenciamento genômico em larga escala, PCR em tempo real, mapeamento citogenético, entre outras, foram realizadas no sentido do entendimento do conteúdo genômico e história evolutiva do cromossomo B do ciclídeo africano Astatotilapia latifasciata. Estas análises evidenciaram que o elemento extra desta espécie foi originado a partir de um pequeno segmento cromossômico do genoma A, seguido de invasão e amplificação de sequências oriundas de diversos cromossomos do complemento A, e também do genoma mitocondrial. Considerando os aspectos citados, atrelados à possibilidade do uso de novas ferramentas de análises em larga escala como transcriptomas, microRNomas e ChIP-Seq, o presente projeto visa o melhor entendimento do papel funcional da presença de cromossomos B, usando o ciclídeo A. latifasciata como modelo. (AU)

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Publicações científicas (12)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
FANTINATTI, BRUNO E. A.; MARTINS, CESAR. . BMC GENETICS, v. 17, . (11/03807-7, 13/04533-3)
OLIVEIRA, SARAH G.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; MOURA, RITA C.; MARTINS, CESAR. . MOLECULAR CYTOGENETICS, v. 6, . (09/04351-7, 08/02830-2, 13/04533-3)
VALENTE, GUILHERME; KOCHER, THOMAS; EICKBUSH, THOMAS; SIMOES, RAFAEL P.; MARTINS, CESAR. . Molecular Genetics and Genomics, v. 291, n. 3, p. 1219-1225, . (11/03807-7, 13/04533-3)
CARMELLO, BIANCA O.; COAN, RAFAEL L. B.; CARDOSO, ADAUTO L.; RAMOS, ERICA; FANTINATTI, BRUNO E. A.; MARQUES, DIEGO F.; OLIVEIRA, ROGERIO A.; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. . Chromosome Research, v. 25, n. 3-4, p. 277-290, . (11/03807-7, 15/16661-1, 13/04533-3)
COAN, RAFAEL L. B.; MARTINS, CESAR. . GENES, v. 9, n. 6, . (14/16763-6, 15/16661-1, 13/04533-3)
CARDOSO, ADAUTO LIMA; DE ALMEIDA FANTINATTI, BRUNO EVARISTO; VENTURELLI, NATALIA BORTHOLAZZI; CARMELLO, BIANCA DE OLIVEIRA; DE OLIVEIRA, ROGERIO ANTONIO; MARTINS, CESAR. Epigenetic DNA Modifications Are Correlated With B Chromosomes and Sex in the Cichlid Astatotilapia latifasciata. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, . (15/16661-1, 13/04533-3, 12/21546-9)
CARDOSO, ADAUTO LIMA; DE ALMEIDA FANTINATTI, BRUNO EVARISTO; VENTURELLI, NATALIA BORTHOLAZZI; CARMELLO, BIANCA DE OLIVEIRA; DE OLIVEIRA, ROGERIO ANTONIO; MARTINS, CESAR. . FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, p. 14-pg., . (12/21546-9, 13/04533-3, 15/16661-1)
SCHEMBERGER, MICHELLE ORANE; NOGAROTO, VIVIANE; ALMEIDA, MARA CRISTINA; ARTONI, ROBERTO FERREIRA; VALENTE, GUILHERME TARGINO; MARTINS, CESAR; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; CESTARI, MARTA MARGARETE; VICARI, MARCELO RICARDO. . Gene, v. 593, n. 2, p. 308-314, . (12/15258-0, 13/04533-3)
VALENTE, GUILHERME T.; NAKAJIMA, RAFAEL T.; FANTINATTI, BRUNO E. A.; MARQUES, DIEGO F.; ALMEIDA, RODRIGO O.; SIMOES, RAFAEL P.; MARTINS, CESAR. . CHROMOSOMA, v. 126, n. 1, p. 73-81, . (13/04533-3)
RAMOS, ERICA; CARDOSO, ADAUTO L.; BROWN, JUDITH; MARQUES, DIEGO F.; FANTINATTI, BRUNO E. A.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; OLIVEIRA, ROGERIO A.; O'NEILL, RACHEL J.; MARTINS, CESAR. . CHROMOSOMA, v. 126, n. 2, p. 313-323, . (12/20959-8, 10/17212-2, 13/04533-3)
JEHANGIR, MARYAM; AHMAD, SYED F.; CARDOSO, ADAUTO L.; RAMOS, ERICA; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. . CHROMOSOMA, v. 128, n. 2, p. 81-96, . (14/17683-6, 11/03807-7, 15/16661-1, 13/04533-3)
MARTINS, CESAR; NAKAJIMA, RAFAEL T.; FANTINNATI, BRUNO E.; MARQUES, DIEGO F.; VENTURELLI, NATALIA B.; JEHANGIR, MARYAM; RAMOS, ERICA; OLIVEIRA, JORDANA; AHMAD, SYED F.; BOVOLENTA, LUIZ A.; et al. . COMPARATIVE CYTOGENETICS, v. 12, n. 3, p. 2-pg., . (15/16661-1, 13/04533-3)