Montagem genômica do ciclídeo Astatotilapia latifasciata com foco em genômica populacional de polimorfimo de cromossomo b

Resumo

Cromossomos B em A. latifasciata tem sido estudado com foco em citogenética. As tecnologias de sequenciamento de próxima geração (NGS) podem ser utilizadas para análises genômicas em larga escala. Apesar do poder de sequenciamento do NGS, o curto tamanho das sequências geradas cria sérias limitações às muitas aplicações biológicas. O genoma do peixe ciclídeo A. latifasciata vem sendo explorados como modelo para investigar cromossomos B. A montagem do genoma de A. latifasciata não foi ainda realizado. O foco principal deste estudo será analisar e montar o genoma de A. latifasciata sem cromossomos B (0B) baseado em alta cobertura obtidas pelas plataformas Illumina e PacBio. Além disso, alta cobertura de dados será obtida para genomas de machos e fêmeas com 0B, 1B e 2B. Esta abordagem será útil para fornecer informações relacionadas ao polimorfismo de cromossomos B presentes em A. latifasciata. A montagem do genoma de A. latifasciata abre a perspectiva de avançar no entendimento da biologia do cromossomo B e também pode contribuir no conhecimento da estonteante história evolutiva dos ciclídeos Africanos. (AU)