Polimorfismo de rpoS em isolados naturais de Escherichia coli

Resumo

O genoma de Escherichia coli codifica para sete fatores sigma diferentes. O fator sigmaprincipal, Ã70 , é responsável pela transcrição da maioria dos genes, principalmente daquelesassociados ao crescimento bacteriano. RpoS (ÃS ) é o segundo em importância, sendo responsável pela transcrição de mais de uma centena de genes envolvidos na resposta ao estresse.Apesar de sua relevância, o gene rpoS é muito polimórfico e os níveis proteicos deste fatorsigma são muito variáveis. A frequência de mutações nulas em rpoS é muito maior do quea esperada para mutações espontâneas. Isso ocorre porque há uma forte pressão seletivasobre rpoS e sobre os genes que regulam a sua expressão. Neste projeto, iremos determinaro nível de polimorfismo de rpoS na espécie E. coli em uma análise longitudinal de 12 mesesde duração. Amostras coletadas mensalmente serão analisadas em relação à presença de RpoS, seu nível intrínseco, polimorfismo genético, frequência de mutações espontâneas eadaptativas, aptidão e outras características. Os dados obtidos serão correlacionados com ogenótipo de rpoS e o nível de RpoS dos isolados. Como controle, será realizada uma análisemetagenômica para avaliar a variabilidade de rpoS diretamente do córrego. Paralelamente, será investigado o mecanismo pelo qual RpoS afeta negativamente a transcrição de genes dependentes de Ã70 . (AU)