Identificação de genes envolvidos na formação da teca em Arcella intermedia leavis através de transcriptomas

Resumo

Os arcellinídeos são amebas que possuem uma carapaça (teca) externa. Tecamebas se reproduzem por divisão binária, sendo que cada divisão é precedida pela formação de uma nova teca. As tecas apresentam grande diversidade de formas e tamanhos, podem ser secretadas ou aglutinadas e variam quanto à composição química entre as diferentes linhagens de Tecamebas. Recentemente as tecas apresentam papel principal em diversos trabalhos. A forma como se dá a construção das tecas é conhecida morfologicamente e foi descrita em alguns trabalhos que se complementaram. No entanto, não compreendemos molecularmente a formação das tecas. Os genes expressos com funcionalidade na morfogênese das tecas são desconhecidos para todas as linhagens de tecamebas. Com sequenciamento de RNA (transcriptoma) podemos identificar genes e transcritos ativos em diferentes condições e processos, como a morfogênese das tecas. Análises de transcriptoma caracterizam a atividade transcricional e expressão gênica. Grande parte dos genes envolvidos em processos biológicos centrais são conservados mesmo entre linhagens filogeneticamente distantes, sendo que eventos como duplicação gênica podem estar relacionados à "novidades evolutivas" ao longo do tempo evolutivo, como o surgimento de amebas tecadas, e podem ser identificados por meio de RNA-seq. Arcella intermedia leavis (Arcellinida) é uma espécie de tecameba que secreta sua teca, abundante em ambiente de água doce, possível de cultivar e bastante utilizada em experimentos moleculares. O objetivo deste projeto é buscar os possíveis genes envolvidos na morfogênese das tecas, estudando a expressão gênica na formação da teca, utilizando Arcella leavis intermedia como organismo modelo. Serão obtidos transcriptomas de indivíduos de Arcella intermedia leavis em dois momentos distintos do ciclo de vida: Indivíduos antes do início da formação da nova teca e indivíduos formando a nova teca. Os transcriptomas obtidos serão analisados e comparados entre si, identificando as diferenças qualitativas e quantitativas quanto à expressão gênica. Este estudo é o primeiro passo para a compreenção molecular da formação da teca, com a descrição dos genes envolvidos, possibilitando trabalhar questões relacionadas à evolução destes microorganismos e evolução molecular dos genomas. Descreveremos os possíveis processos e vias metabólicas relacionados aos genes envolvidos na tecagenese com base em genes homólogos presentes e descritos em outros organismos, dando base para descrições futuras e o esclarecimento do papel do genótipo na diversidade fenotípica de tecameba. (AU)