| Processo: | 18/00031-7 |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Regular |
| Data de Início da vigência: | 01 de dezembro de 2018 |
| Data de Término da vigência: | 30 de novembro de 2021 |
| Área do conhecimento: | Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Teoria da Computação |
| Pesquisador responsável: | João Meidanis |
| Beneficiário: | João Meidanis |
| Instituição Sede: | Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 20/00975-5 - Aplicações da Teoria Matricial de Rearranjos de Genomas, BP.TT |
| Assunto(s): | Biologia computacional |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Arvores Filogenéticas | distância entre genomas | Reconstrução de ancestrais | Biologia Computacional |
Resumo
Este projeto busca avançar a teoria matricial de rearranjo de genomas,introduzida por Meidanis, Zanetti e Biller, aplicando-a a casos práticosde comparação de genomas de micróbios, fungos, plantas e mamíferos,através de colaborações com biocientistas. Os principais problemas aatacar aqui giram em torno da construção de filogenias usando rearranjos,e a inferência dos genomas ancestrais nos nós internos destas filogenias.Ao mesmo tempo, é objetivodo projeto refinar os métodos do ponto de vista matemático e computacional,aperfeiçoando os algoritmos que os implementam, e complementando-oscom ferramentas de suporte para facilitar seu uso na prática. (AU)
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