Diversidade genética dos genes HLA de classe II em populações mundiais e detecção de variantes que influenciam o perfil de expressão desses genes

Resumo

Os genes HLA de classe II codificam moléculas que participam do processo de apresentação antigênica, sendo, portanto, importante em diversos contextos fisiológico e patológicos, como infecções, reação enxerto-hospedeiro, neoplasias e doenças autoimunes. A variabilidade é uma importante característica desses genes, permitindo a apresentação de milhares de peptídeos diferentes. Polimorfismos em íntrons e regiões regulatórias podem ter efeitos significativos na função biológica desses genes, tais como mudanças nos seus níveis de expressão e edição alternativa do transcrito primário. Avaliaremos a diversidade genética (SNPs e haplótipos) dos principais genes da região do MHC de classe II, HLA-DRA, HLA-DRB1, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DPA1, HLA-DPB1, TAP1, TAP2, HLA-DMA, HLA-DMB, HLA-DOA e HLA-DOB, em 4507 amostras de 84 populações diferentes, por meio de sequenciamento de nova geração e métodos computacionais elaborados para este projeto. Em seguida, será avaliado o perfil de expressão desses genes em 460 amostras da fase anterior, buscando-se variantes que influenciam o perfil de expressão e de edição do transcrito primário. Os dados de variabilidade constituirão o perfil das populações estudadas e poderão ser usados futuramente em estudos populacionais e em estudos de associações com doenças, em especial doenças autoimunes. (AU)