Estudo da arquitetura genética e predição genômica para características seminais e eficiência reprodutiva de fêmeas em bovinos nelore

Resumo

Este estudo irá avaliar a inclusão de informações genômicas na predição de valores genéticos, com ou sem a inclusão de marcadores do cromossomo X, bem como explorar nosso conhecimento dos mecanismos que modulam a arquitetura genética de características andrológicas e da qualidade do sêmen em machos e precocidade em fêmeas em bovinos Nelore. O conjunto de dados consiste em informações de linhagem contendo 660.608 animais, com aproximadamente oito gerações equivalentes. Dados fenotípicos de novilhas, vacas e touros Nelore, variando de aproximadamente 10.000 a 100.000 em número, com idade entre 14 a 48 meses e nascidos entre 1998 e 2020. Informações sobre 7.303 animais genotipados para 44.135 SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) usando o SNP GeneSeek Chip Beadchips Chip bovino GGP-HDi. A escolha de modelos animais adequados para as análises será feita como parte do desenvolvimento deste estudo, e a análise será realizada com base no método BLUP genômico de etapa única. As análises GWAS serão realizadas utilizando a metodologia GWAS de etapa única considerando o mesmo modelo animal linear utilizado para estimar os componentes de variância e serão realizadas em dois cenários: primeiro, sem a inclusão de marcadores localizados no cromossomo X, e segundo, com o inclusão de marcadores no cromossomo X. Com base nas estimativas das médias dos componentes de (co) variância obtidas com o modelo que incluiu o cromossomo X + autossomos e o modelo que incluiu apenas autossomos, obteremos dois valores genéticos para os animais, calculados pelo método de etapa única proposto. e o desempenho preditivo será calculado usando o conjunto de dados que foi dividido em subconjuntos de treinamento e validação. Devemos obter informações confiáveis e criar ferramentas para melhorar o desempenho reprodutivo dos animais Nelore. (AU)