High density genome wide genotyping on a pedigree of AIRmin and AIRmax mice to map and characterize new loci involved in lung and intestinal tumour development

• Processo: 17/50407-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Imunologia - Imunogenética
• Proposta de Mobilidade: SPRINT - Projetos de pesquisa - Mobilidade
• Pesquisador responsável: Olga Celia Martinez Ibanez
• Beneficiário: Olga Celia Martinez Ibanez
• Pesquisador Responsável no exterior: Tommaso Antonio Dragani
• Instituição Parceira no exterior: Istituto Nazionale per lo Studio e la Cura dei Tumori, Itália
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 16/07007-9 - Análise do efeito fenotípico de SNPs situados no locus Irm1 que regula a produção de IL-1beta em camundongos., AP.R
• Assunto(s): Predisposição genética para doença Neoplasias pulmonares Resposta inflamatória Técnicas de genotipagem Genomas Transcriptoma Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Imunologia

Resumo

Duas linhagens não isogênicas de camundongos, selecionadas fenotipicamente para resistência (AIRmin) e susceptibilidade (AIRmax) à resposta inflamatória aguda (AIR) mostram susceptibilidade/resistência diferencial ao desenvolvimento de vários tipos de tumores após tratamento com carcinógenos químicos. No Instituto Butantan foi produzida uma população intercruzada destes animais (AIRmax x AIRmin) F2 e tratada com o carcinógeno químico dimetilhidrazina, que induz tumores no pulmão e no intestino. Graças à colaboração com o Instituto Nazionale dei Tumori na Itália, o presente projeto tem o objetivo de realizar a genotipagem em alta densidade em todo o genoma com a técnica inovadora 2B_RAD para mapear loci genéticos que modulam múltiplos fenótipos: susceptibilidade genética individual a câncer de pulmão e de intestino e a inflamação aguda. Além disso, está planejado realizar análise de transcriptoma em tecido de tumores de pulmão e mapear loci que regulam características quantitativas (QTL) que modulam o nível de expressão de genes (QTL) relacionados ao fenótipo de tumor pulmonar. No conjunto, resultados do projeto irão fornece um melhor conhecimento da relação entre variação genômica, predisposição genética individual à tumorigênese e controle de expressão gênica em tumores. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BORREGO, ANDREA; JENSEN, JOSE RICARDO; KOURY CABRERA, WAFA HANNA; MASSA, SOLANGE; RIBEIRO, ORLANDO GARCIA; STAROBINAS, NANCY; DE FRANCO, MARCELO; ETO, SILAS FERNANDES; MANENTI, GIACOMO; DRAGANI, TOMMASO ANTONIO; et al. Mapping of novel loci involved in lung and colon tumor susceptibility by the use of genetically selected mouse strains. Genes and Immunity, DEC 2021. (17/50407-0)