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EMU concedido no processo 2017/10630-2: servidor

Processo: 18/20026-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
Vigência: 01 de novembro de 2018 - 31 de outubro de 2025
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Lucia Galvão de Albuquerque
Beneficiário:Lucia Galvão de Albuquerque
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:17/10630-2 - Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore, AP.TEM
Assunto(s):Biologia computacional  Análise de sequência de DNA  Eficiência alimentar  Qualidade da carne  Equipamentos multiusuários 
As informações abaixo são de responsabilidade do Pesquisador responsável.
Página web do EMU:http://www.fcav.unesp.br/#!/servicos/equipamentos-multiusuarios/servidor-multiusuario-para-analise-da-dados/
Tipo de equipamento:Infraestrutura - Tecnologia da Informação - Servidores
Fabricante: Intel
Modelo: 80 processadores

Resumo

EMU concedido no processo 2017/10630-2: Servidor. Resumo do projeto temático. De maneira geral, os rebanhos brasileiros precisam melhorar seus índices de eficiência e de qualidade do produto final que é a carne. Além disto, atualmente, existe uma preocupação mundial quanto ao aspecto da sustentabilidade da produção animal, o qual poderá ser melhorado por meio da seleção de animais que emitam menor quantidade de metano entérico para a atmosfera. Com a evolução das técnicas de sequenciamento completo do genoma e a diminuição do custo por animal, o sequenciamento tem sido proposto como alternativa aos chips de SNP, apresentando uma série de vantagens em relação aos mesmos. Assim, o presente projeto visa criar um banco de dados de emissão de metano entérico e utilizar um conjunto de informações de características de eficiência alimentar, qualidade de carne e carcaça bem como de reprodução, para realizar estudos genômicos com base em sequência completa do DNA, visando desenvolver tecnologias que permitam o melhor conhecimento biológico e o melhoramento da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de bovinos da raça Nelore. A princípio, serão desenvolvidos os seguintes tópicos no projeto: a) Estudo genético-quantitativo de características relacionadas à emissão de metano entérico e suas associações genéticas com características de eficiência alimentar; b) Estudo da acurácia de imputação para a sequência completa a partir de animais genotipados com chips comerciais com diferentes números de SNPs e utilizando diferentes métodos; c) Estudo da caracterização do genoma do Nelore utilizando dados de sequenciamento; d) Estudo de associação genômica ampla para características de importância econômica utilizando a sequência completa do genoma juntamente com o mapeamento fino de genes candidatos, visando à identificação das mutações causais e busca de mutações deletérias; e) Estudo de seleção genômica realizada com base em dados de sequenciamento para características relacionadas com a qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne; f) Análise de expressão gênica de características relacionadas com eficiência alimentar (transcriptoma). (AU)