Diagnóstico molecular rápido, eficaz e de baixo custo do COVID-19 e estratégias para testagem populacional em larga escala

• Processo: 20/05949-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2020
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Mayana Zatz
• Beneficiário: Mayana Zatz
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Germán Gustavo Sgro ; Maria Rita dos Santos e Passos Bueno ; Michel Satya Naslavsky ; Miguel Mitne Neto ; Shaker Chuck Farah ; Yeda Aparecida de Oliveira Duarte
• Vinculado ao auxílio: 13/08028-1 - CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco, AP.CEPID
• Assunto(s): Genômica COVID-19 SARS-CoV-2 Infecções por Coronavirus Programas de rastreamento Testagem em massa da população Técnicas de diagnóstico molecular Testes imediatos Tecnologia de baixo custo Pandemias Controle de doenças transmissíveis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Covid-19 | diagnóstico | testagem populacional | Teste molecular | Genômica Molecular

Resumo

O maior sucesso de controle da pandemia desencadeada pelo novo coronavírus (SARS-CoV-2), denominada COVID-19, tem sido observado entre países com grande capacidade de oferecer testes à população, como a Coreia do Sul (Normile, 2020). Entretanto, com a crescente necessidade de insumos, muitas vezes importados, para a realização dos testes, países capazes de redirecionar a indústria interna para produzir os próprios insumos têm conseguido aliviar satisfatoriamente a demanda por testes, como é o caso da Alemanha, Coreia do Sul e Singapura (Editorial in Nature) (2020). Porém, a maioria dos países não possui capacidade tecnológica para serem autossuficientes na produção de testes, particularmente do teste de RT-qPCR por TaqMan®, que é o majoritariamente utilizado e recomendado pelo CDC (Centers for Disease Control and Prevention) dos EUA (Reusken et al., 2020). Cresce, assim, a urgência de desenvolver testes que utilizem insumos alternativos e que, idealmente, sejam ao mesmo tempo rápidos, eficientes e de baixo custo. No Brasil, a dependência da importação de insumos tem sido um dos principais limitantes para realização dos testes de diagnóstico para COVID-19, pois ela ao mesmo tempo atrasa e encarece o processo. Diante dessas limitações, nossa proposta é desenvolver um método baseado em biologia molecular com a metodologia RT-LAMP (reverse transcription loop-mediated isothermal amplification; RT-LAMP), que não depende de equipamentos sofisticados e pode ser realizado em qualquer local do país, mesmo naqueles com pouca infraestrutura (Hong et al., 2004; Lamb et al., 2020; Shirato et al., 2014; Silva et al., 2019a; Zhang et al., 2020). Além disso, produziremos as enzimas necessárias para a realização do teste. Também iremos testar a sensibilidade do teste com pools 5 a 20 amostras juntas, o que poderá viabilizar aumentar a triagem de um grande número de casos e identificar grupos populacionais de maior risco. O desenvolvimento desses protocolos criará conhecimento tecnológico para o desenvolvimento de métodos de diagnóstico molecular rápido para a COVID-19 de produção nacional, facilmente adaptável para outros patógenos, assim contribuindo para a preparação do país para enfrentar crises similares no futuro, bem como desenvolver abordagens de triagem populacional que podem orientar o controle da epidemia do SARS-CoV-2. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

KOBAYASHI, GERSON SHIGERU; BRITO, LUCIANO ABREU; MOREIRA, DANIELLE DE PAULA; SUZUKI, ANGELA MAY; PING HSIA, GABRIELLA SHIH; PIMENTEL, LYLYAN FRAGOSO; BARRETO DE PAIVA, ANA PAULA; DIAS, CAROLINA REGOLI; VILACA LOURENCO, NAILA CRISTINA; OLIVEIRA, BEATRIZ ARAUJO; et al. A Novel Saliva RT-LAMP Workflow for Rapid Identification of COVID-19 Cases and Restraining Viral Spread. DIAGNOSTICS, v. 11, n. 8, AUG 2021. (13/08028-1, 20/05949-2)