Bactérias endofíticas associadas à Phytophthora spp. em citros e mandioca: diversidade e controle biológico

• Processo: 22/10196-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2023
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2025
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Acordo de Cooperação: CONFAP - Conselho Nacional das Fundações Estaduais de Amparo à Pesquisa
• Pesquisador responsável: Welington Luiz de Araújo
• Beneficiário: Welington Luiz de Araújo
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/03459-6 - Organização de uma coleção de culturas de micro-organismos de mandioca e citros, BP.TT
• Assunto(s): Microbiologia aplicada Anti-infecciosos Controle biológico Biodiversidade Diversidade microbiana Metagenômica Micro-organismos endofíticos Phytophthora Citrus Mandioca
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Antimicrobianos | biocontrole | diversidade microbiana | metagenômica | Microbiologia aplicada

Resumo

O gênero Phytophthora é um dos mais importantes entre os oomicetos fitopatogênicos, podendo infectar um grande número de espécies cultivadas de importância socio-econômica para a população mundial, assim como muitas plantas não cultivadas. Neste contexto, é relevante identificar a diversidade e variabilidade genética deste fitopatógenos isolado de diferentes plantas hospedeiras (em especial citros e mandioca) e avaliar estratégias sustentáveis de controle deste fitopatógeno. Assim, considerando a interação entre a comunidade endofítica (em especial Burkholderia spp. e Methylobacterium spp.) com a planta hospedeira, e com patógenos associados, é possível identificar padrões desta comunidade que estejam associados à maior susceptibilidade da planta aos patógenos bem como identificar potenciais micro-organismos com potencial para o controle biológico. Dessa forma, na presente proposta o microbioma associado aos caules de citros e raízes de mandioca será caracterizado por métodos independentes de cultivo (diversidade taxonômica e funcional) e capacidade de Burkholderia spp. e Methylobacterium spp. em produzir compostos de interesse biotecnológico e inibir Phytophthora spp. será avaliada. Para isso, amostras de citros (especialmente no estado de São Paulo) e mandioca (especialmente no estado do Pará) serão coletadas de áreas com a presença ou não de gomose (citros) ou podridão radicular (mandioca) e a diversidade microbiana associada às plantas será avaliada. Além disso, isolados de Phytophthora spp. serão obtidos destas plantas e a diversidade e variabilidade genética avaliada por métodos moleculares, permitindo comparar a variação genética destes isolados obtidos nos dois estados e das duas espécies vegetais. A presente proposta visa alcançar um resultado ainda não descrito na literatura brasileira, descrevendo o microbioma de citros e mandioca e a sua interação com Phytophthora spp., além de permitir avaliar o risco de infecção cruzada de mandioca para citros e vice-versa e propor modelos de controle biológico deste fitopatógeno. (AU)