Análise genômica, transcriptômica e caracterização fenotípica de linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de diferentes fontes no Brasil

• Processo: 24/18739-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2027
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Juliana Pfrimer Falcão
• Beneficiário: Juliana Pfrimer Falcão
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Campylobacter jejuni Transcriptoma Bacteriologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Campylobacter jejuni | sequenciamento do genoma | Testes fenotípicos relacionados à virulência e sobrevivência | Transcriptoma | Bacteriologia

Resumo

A campilobacteriose é uma das principais doenças diarreiogênicas em diferentes países. A espécie Campylobacter jejuni é responsável por aproximadamente 90% dessas infecções em humanos, e a carne de aves é o principal veículo de sua transmissão. No Brasil, o estudo e o isolamento de C. jejuni são reportados com menor frequência, o que dificulta a avaliação da importância e da dimensão desse patógeno no nosso país. Assim, esse projeto tem como objetivos analisar comparativamente por meio do sequenciamento do genoma, sequenciamento do transcriptoma e por testes fenotípicos relacionados à virulência e sobrevivência, linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de fontes diversas ao longo de 27 anos no Brasil. A análise comparativa do genoma sequenciado será realizada para 139 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (n=49), animais (n=49), alimentos (n=41) pela pesquisa da presença de ilhas de patogenicidade, presença de plasmídeos, ilhas metabólicas, cgMLST, ANI, pangenoma, análise das sequencias espaçadoras do sistema CRISPR, predição de genes que codificam Transducer like proteins e abordagem de vacinologia reversa para a predição de possíveis alvos vacinais. Para 60 linhagens selecionadas serão realizados os testes fenotípicos de tolerância ao congelamento e à pasteurização, formação de biofilme e sobrevivência ao ácido peracético. Ademais, para 30 linhagens a serem selecionadas será realizado ensaio de sobrevivência em co-cultivo com Salmonella sp. Por fim, será feita a análise do transcriptoma de três linhagens de C. jejuni submetida ao modelo colônico in vitro SEMH®. Os resultados a serem obtidos no presente trabalho deverão contribuir para uma melhor caracterização fenotípica e molecular de C. jejuni, fornecendo informações inéditas e de extrema relevância sobre as possíveis diferenças na patogenicidade, virulência, possíveis alvos vacinais e diversidade genotípica de linhagens isoladas de humanos, animais e alimentos durante 27 anos no Brasil. (AU)