Estudos genômicos comparativos da expressão gênica global de fungos filamentosos crescidos em bagaço e colmo de cana-de-açúcar

• Processo: 11/08945-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2011
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Juliana Velasco de Castro Oliveira
• Beneficiário: Juliana Velasco de Castro Oliveira
• Instituição Sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Gustavo Henrique Goldman ; Marcos Silveira Buckeridge ; Roberto Marcondes Cesar Junior
• Assunto(s): Fungos Aspergillus niger Trichoderma Etanol Cana-de-açúcar Enzimas hidrolíticas Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala Análise de sequência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aspergillus niger | Etanol de segunda geração | Fungo filamentoso | RNA-seq | Sequenciamento em larga escala | Trichoderma reesei | Biologia Molecular

Resumo

A dependência de fontes de combustíveis fósseis bem como a preocupação com o meio ambiente tem gerado mundialmente um grande interesse no desenvolvimento de outras fontes de combustível e energia. Neste sentido, o uso de etanol como combustível é vantajoso por se tratar de uma fonte inesgotável de energia, sendo considerada de baixo impacto ambiental. Atualmente, através da fermentação do caldo da cana-de-açúcar, o Brasil é o segundo maior produtor de bioetanol. Entretanto, estudos sugerem que se forem utilizados o bagaço e a palha da cana, o Brasil pode dobrar sua produção, sem a necessidade do aumento de áreas cultiváveis. No entanto, o uso dessa biomassa apresenta como desafio a degradação da estrutura da parede celular vegetal formada por açúcares complexos, como celulose e hemicelulose, em açúcares mais simples, fermentáveis. Para isso, são necessários diversos tipos de enzimas hidrolíticas, que sabidamente são produzidas por uma variedade de microorganismos; dentre eles destacam-se os fungos filamentosos Aspergillus niger e Trichoderna reesei, capazes de produzi-las e secretá-las em grandes quantidades. Embora diversos estudos sejam realizados com estes microorganismos, ainda não são conhecidos exatamente os mecanismos de degradação destes substratos; assim, este projeto tem como objetivo analisar a expressão global por RNA-seq dos genes de A. niger e T. reesei, em meio com bagaço e colmo de cana-de-açúcar. Além de contribuir com o entendimento básico do processo de degradação destas biomassas, todo o conhecimento em âmbito molecular resultante deste trabalho refletirá em novas perspectivas para o desenvolvimento de coquetéis enzimáticos, possibilitando a produção de etanol de segunda geração em escala industrial. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BORIN, GUSTAVO PAGOTTO; SANCHEZ, CAMILA CRISTINA; DE SANTANA, ELIANE SILVA; ZANINI, GUILHERME KEPPE; CORREA DOS SANTOS, RENATO AUGUSTO; PONTES, ANGELICA DE OLIVEIRA; DE SOUZA, ALINE TIEPPO; TAVARES SOARES DAL'MAS, ROBERTA MARIA MENEGALDO; RIANO-PACHON, DIEGO MAURICIO; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE; et al. Comparative transcriptome analysis reveals different strategies for degradation of steam-exploded sugarcane bagasse by Aspergillus niger and Trichoderma reesei. BMC Genomics, v. 18, JUN 30 2017. (11/08945-9, 15/08222-8, 14/15799-7, 13/09541-4, 14/11733-1, 14/11766-7)

BORIN, GUSTAVO PAGOTTO; SANCHEZ, CAMILA CRISTINA; DE SOUZA, AMANDA PEREIRA; DE SANTANA, ELIANE SILVA; DE SOUZA, ALINE TIEPPO; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; SQUINA, FABIO MARCIO; BUCKERIDGE, MARCOS; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE; DE CASTRO OLIVEIRA, JULIANA VELASCO. Comparative Secretome Analysis of Trichoderma reesei and Aspergillus niger during Growth on Sugarcane Biomass. PLoS One, v. 10, n. 6, JUN 8 2015. (13/01071-9, 13/09541-4, 11/08945-9)

DE VRIES, RONALD P.; RILEY, ROBERT; WIEBENGA, AD; AGUILAR-OSORIO, GUILLERMO; AMILLIS, SOTIRIS; UCHIMA, CRISTIANE AKEMI; ANDERLUH, GREGOR; ASADOLLAHI, MOJTABA; ASKIN, MARION; BARRY, KERRIE; et al. Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus. Genome Biology, v. 18, FEB 14 2017. (14/06923-6, 12/20549-4, 12/19040-0, 11/08945-9, 14/10351-8, 14/11766-7)

DE VRIES, RONALD P.; RILEY, ROBERT; WIEBENGA, AD; AGUILAR-OSORIO, GUILLERMO; AMILLIS, SOTIRIS; UCHIMA, CRISTIANE AKEMI; ANDERLUH, GREGOR; ASADOLLAHI, MOJTABA; ASKIN, MARION; BARRY, KERRIE; et al. Comparative genomics reveals high biological diversity and specific adaptations in the industrially and medically important fungal genus Aspergillus. GENOME BIOLOGY, v. 18, p. 45-pg., 2017-02-14. (11/08945-9, 14/06923-6, 12/19040-0, 14/10351-8, 14/11766-7, 12/20549-4)