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Aptâmeros para descoberta de marcadores diagnósticos e inibidores terapêuticos em doenças infecciosas

Processo: 12/50393-6
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de dezembro de 2012 - 31 de maio de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Parasitologia
Pesquisador responsável:Alexander Henning Ulrich
Beneficiário:Alexander Henning Ulrich
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Doenças parasitárias  Plasmodium  Trypanosoma cruzi  Marcador molecular  Oligonucleotídeos  Aptâmeros de nucleotídeos 

Resumo

Aptameros de DNA interagem com alvos protéicos com alta especificidade, seletividade e afinidade. Ciclos iterativos de triagem in vitro de uma biblioteca combinatória de oligonucleotídeos para ligação a alvos (SELEX), seguido por amplificação PCR de sequências selecionadas pode ser desenvolvido para atingir quase qualquer proteína. Devido ao amplo espectro de aplicações, essas novas moléculas são usadas em numerosos processos farmacológicos, clínicos e industriais. Enquanto a técnica ainda emerge no Brasil, ela é amplamente utilizada para aplicações acadêmicas e industriais em muitos países industrializados. A meta de propor um projeto conjunto Brasil-Alemanha visa explorar a tecnologia SELEX direcionada à organismos causadores de doenças parasitárias Plasmodium falciparum, Onchocerca volvolus e Trypanosoma cruzi. Os aptameros evoluídos com alta afinidade serão usados para purificação de proteínas mediada pela interação entre o ligante e o alvo. Ensaios de inibição vão elucidar os efeitos da ligação do aptamero a proteína alvo. A importância de proteínas do P. falciparum, identificados pelos aptameros na membrana do eritrócito, em seguida senrá estudada em ensaios de tráfico de proteínas e de proliferação. Çonstrutos knock-out dessas proteínas são previstas para avaliar as proteínas identificadas e sua viabilidade no parasita. Adicionalmente para criar conhecimento científico, este projeto vai permitir um contínuo intercâmbio de cientistas e estudantes com a intenção de criar um grupo de pesquisa duradouro. Além disso, desde que aplicações terapêuticas são previstas para a maioria dos aptameros desenvolvidos, esses seriam comercializados traduzindo-se em uma estrutura de Parceria Público-Privada. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MENCIN, NINA; SMUC, TINA; VRANICAR, MARKO; MAVRI, JAN; HREN, MATJAZ; GALESA, KATJA; KRKOC, PETER; ULRICH, HENNING; SOLAR, BORUT. Optimization of SELEX: Comparison of different methods for monitoring the progress of in vitro selection of aptamers. Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, v. 91, p. 151-159, MAR 25 2014. Citações Web of Science: 21.
SMUC, TINA; AHN, IL-YOUNG; ULRICH, HENNING. Nucleic acid aptamers as high affinity ligands in biotechnology and biosensorics. Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, v. 81-82, p. 210-217, JUL-AUG 2013. Citações Web of Science: 52.
ZIMBRES, FLAVIA M.; TARNOK, ATTILA; ULRICH, HENNING; WRENGER, CARSTEN. Aptamers: Novel Molecules as Diagnostic Markers in Bacterial and Viral Infections?. BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL, 2013. Citações Web of Science: 22.

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