Caracterização dos mecanismos de ação de RNAs longos não-codificadores envolvidos nos programas de ativação gênica em células humanas

• Processo: 14/03620-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de julho de 2014 - 30 de junho de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Sergio Verjovski Almeida
• Beneficiário: Sergio Verjovski Almeida
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: João Carlos Setubal ; Mari Cleide Sogayar
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/00324-6 - Estudo do controle da expressão gênica do lncRNA INXS envolvido na apoptose, BP.DR; 14/25481-4 - Lipossomos como veículo de entrega do lncRNA INXS à células tumorais in vitro e in vivo para indução de apoptose, BP.IC
• Assunto(s): Apoptose Androgênios Genomas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: apoptose | ativação por andrógeno | diferenciação de hESCs para hNCCs | RNAs longos não-codificadores | Genômica

Resumo

Nos últimos anos, com os dados de sequenciamento em larga escala do projeto público ENCODE, ficou evidente que até 92% do genoma humano pode ser transcrito, e que as dezenas de milhares de RNAs longos (> 200 nucleotídeos) não-codificadores de proteínas (lncRNAs) catalogados até agora representam a classe mais diversa e mais abundante dos RNAs de uma célula, excetuando os RNAs ribossomais. Apesar disso, apenas cerca de duas dezenas de lncRNAs tiveram seus mecanismos moleculares de ação identificados e caracterizados em detalhe, o que tem revelado seu papel como reguladores da transcrição gênica em mamíferos. O desafio atual é encontrar os modelos experimentais e os processos celulares mais relevantes, buscando lncRNAs que sejam alvos chave nestes processos, e mostrar a perda e o ganho de função, em um determinado tipo celular, quando um destes lncRNAs é deletado ou super expresso. O projeto aqui proposto focaliza três processos celulares relevantes - a resposta ao hormônio andrógeno, a apoptose, e a diferenciação de células-tronco embrionárias humanas em células da crista neural - e tem a vantagem de já haver obtido resultados preliminares sobre três novos lncRNAs que são fortes candidatos a possuir papéis reguladores sobre algumas etapas de cada um destes três processos biológicos. Estes três lncRNAs são, respectivamente, o lincPSA, o INXS e o TFAP2A-AS2. A aplicação de novas tecnologias para detectar a interação entre lncRNAs, proteínas e seus possíveis sítios de ligação no DNA genômico, e a detecção em paralelo das modificações de marcas da cromatina e da atividade transcricional de genes, aqui propostas, permitirão entender o papel de cada um dos três lncRNAs, e o conhecimento destes mecanismos poderá abrir portas para o eventual uso desses lncRNAs como alvos terapêuticos. (AU)

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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AMARAL, MURILO SENA; GOULART, ERNESTO; CAIRES-JUNIOR, LUIZ CARLOS; MORALES-VICENTE, DAVID ABRAHAM; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA; GOMES, ROSELANE PAIVA; OLBERG, GIOVANNA GONCALVES DE OLIVEIRA; ASTRAY, RENATO MANCINI; KALIL, JORGE E.; ZATZ, MAYANA; et al. Differential gene expression elicited by ZIKV infection in trophoblasts from congenital Zika syndrome discordant twins. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 8, AUG 2020. (14/03620-2, 13/08028-1, 14/50931-3, 18/23693-5)

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