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Caracterização dos mecanismos de ação de RNAs longos não-codificadores envolvidos nos programas de ativação gênica em células humanas

Resumo

Nos últimos anos, com os dados de sequenciamento em larga escala do projeto público ENCODE, ficou evidente que até 92% do genoma humano pode ser transcrito, e que as dezenas de milhares de RNAs longos (> 200 nucleotídeos) não-codificadores de proteínas (lncRNAs) catalogados até agora representam a classe mais diversa e mais abundante dos RNAs de uma célula, excetuando os RNAs ribossomais. Apesar disso, apenas cerca de duas dezenas de lncRNAs tiveram seus mecanismos moleculares de ação identificados e caracterizados em detalhe, o que tem revelado seu papel como reguladores da transcrição gênica em mamíferos. O desafio atual é encontrar os modelos experimentais e os processos celulares mais relevantes, buscando lncRNAs que sejam alvos chave nestes processos, e mostrar a perda e o ganho de função, em um determinado tipo celular, quando um destes lncRNAs é deletado ou super expresso. O projeto aqui proposto focaliza três processos celulares relevantes - a resposta ao hormônio andrógeno, a apoptose, e a diferenciação de células-tronco embrionárias humanas em células da crista neural - e tem a vantagem de já haver obtido resultados preliminares sobre três novos lncRNAs que são fortes candidatos a possuir papéis reguladores sobre algumas etapas de cada um destes três processos biológicos. Estes três lncRNAs são, respectivamente, o lincPSA, o INXS e o TFAP2A-AS2. A aplicação de novas tecnologias para detectar a interação entre lncRNAs, proteínas e seus possíveis sítios de ligação no DNA genômico, e a detecção em paralelo das modificações de marcas da cromatina e da atividade transcricional de genes, aqui propostas, permitirão entender o papel de cada um dos três lncRNAs, e o conhecimento destes mecanismos poderá abrir portas para o eventual uso desses lncRNAs como alvos terapêuticos. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Las moléculas de ARN regularían la acción de las hormonas en el cáncer de próstata 
Identificadas moléculas de RNA que regulam ação de hormônio no câncer de próstata 
Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio::
El zika al comienzo del embarazo 
Predisposição genética tornaria bebês mais suscetíveis à infecção por zika 
Zika no início da gravidez 
Placenta é mais sensível ao ataque do zika no primeiro trimestre da gestação 

Publicações científicas (8)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
VIDEIRA, ALEXANDRE; BECKEDORFF, FELIPE C.; DASILVA, LUCAS F.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. PVT1 signals an androgen-dependent transcriptional repression program in prostate cancer cells and a set of the repressed genes predicts high-risk tumors. CELL COMMUNICATION AND SIGNALING, v. 19, n. 1 JAN 11 2021. Citações Web of Science: 0.
AMARAL, MURILO SENA; GOULART, ERNESTO; CAIRES-JUNIOR, LUIZ CARLOS; MORALES-VICENTE, DAVID ABRAHAM; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA; GOMES, ROSELANE PAIVA; OLBERG, GIOVANNA GONCALVES DE OLIVEIRA; ASTRAY, RENATO MANCINI; KALIL, JORGE E.; ZATZ, MAYANA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Differential gene expression elicited by ZIKV infection in trophoblasts from congenital Zika syndrome discordant twins. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 8 AUG 2020. Citações Web of Science: 0.
MACIEL, LUCAS F.; MORALES-VICENTE, DAVID A.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Dynamic Expression of Long Non-Coding RNAs Throughout Parasite Sexual and Neural Maturation in Schistosoma Japonicum. NON-CODING RNA, v. 6, n. 2 JUN 2020. Citações Web of Science: 0.
MACIEL, LUCAS F.; MORALES-VICENTE, DAVID A.; SILVEIRA, GILBERT O.; RIBEIRO, RAPHAEL O.; OLBERG, GIOVANNA G. O.; PIRES, DAVID S.; AMARAL, MURILO S.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Weighted Gene Co-Expression Analyses Point to Long Non-Coding RNA Hub Genes at Different Schistosoma mansoni Life-Cycle Stages. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, SEP 12 2019. Citações Web of Science: 0.
DASILVA, LUCAS F.; BECKEDORFF, FELIPE C.; AYUPE, ANA C.; AMARAL, MURILO S.; MESEL, VINICIUS; VIDEIRA, ALEXANDRE; REIS, EDUARDO M.; SETUBAL, JOAO C.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Chromatin Landscape Distinguishes the Genomic Loci of Hundreds of Androgen-Receptor-Associated LincRNAs From the Loci of Non-associated LincRNAs. FRONTIERS IN GENETICS, v. 9, APR 25 2018. Citações Web of Science: 1.
DE CAIRES, JR., LUIZ CARLOS; GOULART, ERNESTO; MELO, UIRASOUTO; HENRIQUE ARAUJO, BRUNO SILVA; ALVIZI, LUCAS; SCHANOSKI, ALESSANDRA SOARES; DE OLIVEIRA, DANYLLO FELIPE; KOBAYASHI, GERSON SHIGERU; GRIESI-OLIVEIRA, KARINA; MUSSO, CAMILA MANSO; AMARAL, MURILOSENA; DASILVA, LUCAS FERREIRA; ASTRAY, RENATO MANCINI; SUAREZ-PATINO, SANDRA FERNANDA; VENTINI, DANIELLA CRISTINA; DA SILVA, SERGIO GOMES; YAMAMOTO, GUILHERME LOPES; EZQUINA, SUZANA; NASLAVSKY, MICHEL SATYA; ALVES SILVA, KAYQUE TELLES; WEINMANN, KARINA; VAN DER LINDEN, VANESSA; VAN DER LINDEN, HELIO; RICARDO DE OLIVEIRA, JOAO MENDES; MARIA ARRAIS, NIVIA RODRIGUES; MELO, ADRIANA; FIGUEIREDO, THALITA; SANTOS, SILVANA; GOES MEIRA, JOANNA CASTRO; PASSOS, SAULO DUARTE; DE ALMEIDA, ROQUE PACHECO; BISPO, ANA JOVINABARRETO; CAVALHEIRO, ESPERABRAO; KALIL, JORGE; CUNHA-NETO, EDECIO; NAKAYA, HELDER; SANTOS, ROBERT ANDREATA; DE SOUZA FERREIRA, LUIS CARLOS; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO; HO, PAULO LEE; PASSOS-BUENO, MARIA RITA; ZATZ, MAYANA. Discordant congenital Zika syndrome twins show differential in vitro viral susceptibility of neural progenitor cells. NATURE COMMUNICATIONS, v. 9, FEB 2 2018. Citações Web of Science: 9.
SHERIDAN, MEGAN A.; YUNUSOV, DINAR; BALARAMAN, VELMURUGAN; ALEXENKO, ANDREI P.; YABE, SHINICHIRO; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO; SCHUST, DANNY J.; FRANZ, ALEXANDER W.; SADOVSKY, YOEL; TOSHIHIKO, EZASHI; ROBERTS, R. MICHAEL. Vulnerability of primitive human placental trophoblast to Zika virus. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 114, n. 9, p. E1587-E1596, FEB 28 2017. Citações Web of Science: 44.
YUNUSOV, DINAR; ANDERSON, LETICIA; DASILVA, LUCAS FERREIRA; WYSOCKA, JOANNA; EZASHI, TOSHIHIKO; ROBERTS, R. MICHAEL; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. HIPSTR and thousands of lncRNAs are heterogeneously expressed in human embryos, primordial germ cells and stable cell lines. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, SEP 8 2016. Citações Web of Science: 14.

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