Desenvolvimento de métodos high-throughput para o estudo de quantitative traits loci relacionados à robustez de leveduras industriais (Saccharomyces cerevisiae)

• Processo: 16/02506-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Gleidson Silva Teixeira
• Beneficiário: Gleidson Silva Teixeira
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira ; Marcelo Falsarella Carazzolle
• Bolsa(s) vinculada(s): 16/18153-6 - Fenotipagem e validação de QTLs relacionados à robustez de leveduras industriais, BP.TT
• Assunto(s): Citometria de fluxo Bioenergia Biocombustíveis Energia renovável Leveduras Saccharomyces cerevisiae
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cas9 | Citometria de fluxo | Crispr | High-throughput | Quantitative Traits Loci | Saccharomyces cerevisiae | Saccharomyces cerevisiae

Resumo

O reconhecimento das consequências ambientais resultantes da utilização de combustíveis fósseis demanda um aumento significativo do uso de fontes de energia renovável. Neste contexto, destaca-se o etanol lignocelulósico, devido à possibilidade de maior aproveitamento da matéria-prima. No entanto, a viabilidade econômica de processos industriais é multifatorial e depende do desempenho das leveduras utilizadas. Por essa razão, leveduras adaptadas às condições industriais - leveduras industriais - têm sido consideradas plataformas adequadas para o desenvolvimento de linhagens, além de alvos para o estudo de genes que conferem tolerância aos estresses observados em condições industriais. Compreender as bases genéticas que conferem robustez à essas leveduras, contribuirá para sua melhoria e para o desenvolvimento de novas linhagens. Porém, tais características são em grande parte determinadas por múltiplos genes - Quantitative Trait Loci (QTLs) -, cuja identificação exige a análise fenotípica de um alto número de segregantes e validação dos possíveis alelos relacionados ao fenótipo estudado. Neste contexto, este trabalho tem como principal objetivo desenvolver ferramentas que tornem o estudo de QTLs mais preciso, menos laborioso e com melhor relação custo-benefício, acelerando o desenvolvimento de linhagens aplicadas à processos industriais. Para isso, pretende-se otimizar métodos de análise e dissecção de tétrades por citometria de fluxo, desenvolver métodos high-throughput automatizados para a fenotipagem de segregantes, implementar ferramentas de bioinformática para o mapeamento de QTLs e otimizar abordagens multiplex baseadas no sistema CRISPR/Cas9 para validação dos potenciais alelos relacionados aos fenótipos estudados. (AU)

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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