Centro emergente de rmn de biomoleculas.

• Processo: 07/52735-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2007
• Data de Término da vigência: 30 de dezembro de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Roberto Kopke Salinas
• Beneficiário: Roberto Kopke Salinas
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 06/61091-0 - Centro emergente de RMN de biomoléculas, AP.JP
• Assunto(s): Simulação de acoplamento molecular Ressonância magnética nuclear Simulação de dinâmica molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biomolecular Nmr | Docking | Molecular Dynamics | Nmr | Phytopathogens | Structural Biology

Resumo

O projeto envolve o uso de técnicas modernas de RMN aplicadas à solução de estruturas de macromoléculas biológicas e ao estudo de interações entre elas. Também envolve o uso de estratégias computacionais, em especial docking e dinâmica molecular, como ferramentas complementares aos estudos experimentais. Entre os sistemas em interesse estão proteínas relacionadas à patogenicidade de Xanthomonas citri e a tropomiosina de músculo esquelético. Com relação à Xanthomonas a idéia é compreender os mecanismos moleculares que podem levar à patogenicidade. A compreensão destes mecanismos ao nível molecular é essencial para se buscar meios eficientes de combate às infecções causadas em plantas cítricas. A escassez de grupos no país empregando RMN para estudar a estrutura de biomoléculas em solução justifica o apoio à criação deste Centro Emergente em RMN de Biomoléculas. O Instituto de Química da USP, por possuir o único equipamento de RMN 500 MHz na cidade de São Paulo é o lugar mais indicado para a localização deste novo Centro. Neste contexto este projeto é inovador. No futuro, este Centro Emergente de RMN de Biomoléculas será disponível para uma gama ampla de colaborações dentro do próprio Instituto e com outros centros de pesquisa na cidade de São Paulo além de ampliar o pequeno grupo de centros especializados atuando nesta área no país. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SOUZA, DIORGE P.; ANDRADE, MAXUEL O.; ALVAREZ-MARTINEZ, CRISTINA E.; ARANTES, GUILHERME M.; FARAH, CHUCK S.; SALINAS, ROBERTO K.. A Component of the Xanthomonadaceae Type IV Secretion System Combines a VirB7 Motif with a N0 Domain Found in Outer Membrane Transport Proteins. PLOS PATHOGENS, v. 7, n. 5, p. e1002031, 2011. (06/61091-0, 07/52735-3, 05/59243-3)