Determinação do tropismo do HIV-1 pelos co-receptores CCR5 e CXCR4 pelo uso de ferramentas de bioinformática

• Processo: 08/51265-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2008
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Jorge Simao do Rosario Casseb
• Beneficiário: Liã Bárbara Arruda
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): HIV-1 Tropismo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Co-Receptores | Hiv-1 | Tropismo

Resumo

Durante a história natural da infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) ocorre a mudança do tropismo das cepas R5 para X4 ou R5X4, ocasionando na depleção das células T e aceleração da progressão da infecção. A ocorrência de mutações nos aminoácidos da região V3 da gp120 do gene env leva a alteração da carga elétrica global desta região e, conseqüentemente, mudança de tropismo pelo co-receptor. A determinação do tropismo é essencial para utilização dos antagonistas de co-receptor como estratégia terapêutica. O tropismo pode ser determinado através de programas preditores da bioínformática que predizem o uso do co-receptor a partir de seqüências de aminoácidos ou nucleotídeos da região V3, os quais também podem avaliar alterações genotípicas características do tropismo viral. Desta forma, é possível determinar precocemente a mudança do tropismo, contribuindo com a adoção de estratégias terapêuticas para impedir o surgimento de cepas X4. Por estas razões, nosso estudo se propõe identificar o padrão de uso dos co-receptores CCR5 e CXCR4 pelas cepas do HIV-1, as características genotípicas envolvidas no tropismo viral e estratégias de predição do tropismo viral através da análise do seqüenciamento da região V3 da gp120 do envelope do HIV-1 pelo uso de ferramentas de bioinformática. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

ARRUDA, LIA BARBARA; FONSECA, LUIZ AUGUSTO M.; DUARTE, ALBERTO J. S.; CASSEB, JORGE. Genetic Diversity on the Integrase Region of the pol Gene among HIV Type 1-Infected Patients Naive for Integrase Inhibitors in Sao Paulo City, Brazil. AIDS Research and Human Retroviruses, v. 26, n. 1, p. 105-107, JAN 2010. (08/51265-6, 08/58138-0)

LIÃ BÁRBARA ARRUDA; MARILIA LADEIRA DE ARAÚJO; MAIRA LUCCIA MARTINEZ; CLAUDIO ROBERTO GONSALEZ; ALBERTO JOSÉ DA SILVA DUARTE; EOIN COAKLEY; YOLANDA LIE; JORGE CASSEB. Determinação do tropismo viral por ensaios genotípicos e fenotípicos em pacientes brasileiros infectados por HIV-1. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 56, n. 4, p. 287-290, 2014-07-00. (08/58138-0, 10/00222-5, 08/51265-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ARRUDA, Liã Bárbara. Determinação do tropismo do HIV-1 pelos correceptores CCR5 e CXCR4 pelo uso de ferramentas de bioinformática.. 2010. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT) São Paulo.