Expressão, purificação e caracterização estrutural e funcional de proteínas relacionadas à patogenicidade de Xylella fastidiosa

• Processo: 08/55690-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2010
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Anete Pereira de Souza
• Beneficiário: Clelton Aparecido dos Santos
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Xylella fastidiosa Virulência Expressão de proteínas Purificação de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Caracterizacao Estrutural | Expressao De Proteinas | Patogenicidade | Purificacao De Proteinas | Xylella Fastidiosa

Resumo

Para que a informação gerada pelo programa de sequenciamento do genoma da bactéria X. fastidiosa seja explorada de forma a gerar potenciais benefícios para nossa agricultura, é imprescindível a análise funcional desse genoma, com estudos que sejam capazes de analisar as funções biológicas dos genes identificados. No que se refere à caracterização estrutural e funcional de proteínas de X. fastidiosa, poucos trabalhos foram realizados, evidenciado a necessidade de estudos com esses objetivos. Ao se conhecer a estrutura tridimensional de uma proteína avança-se no conhecimento: da evolução dos organismos, dos seus mecanismos de virulência e patogenicidade, de seu metabolismo e até mesmo no que se refere ao desenvolvimento de novos produtos biotecnológicos, como fármacos e pesticidas. Neste sentido, o presente projeto de doutoramento visa caracterizar estrutural e funcionalmente seis proteínas supostamente envolvidas com a patogenicidade de X. fastidiosa. As orfs XF1177, XF1625, XF2287, XF0617 e XF1664 tiveram seus estudos iniciados em um projeto anterior, por nosso grupo de pesquisa, porém devido a erros de anotação durante o sequenciamento ou dificuldades nas etapas de expressão/purificação novas etapas de clonagem, expressão e purificação serão necessárias antes da caracterização, assim como para a nova orfs (XF1808) que será estudada. Tais esforços poderão contribuir, significativamente, para o entendimento do comportamento destas bactérias no ambiente, bem como ajudar na elucidação dos seus mecanismos de patogenicidade. Este estudo vem, em acréscimo, contribuir com a análise funcional do genoma da X. fastidiosa. (AU)

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PEREIRA MACHADO, AGNES THIANE; BARRETO FONSECA, EMANUELLA MARIA; DOS REIS, MARCELO AUGUSTO; SARAIVA, ANTONIO MARCOS; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; SZYMANSKI DE TOLEDO, MARCELO AUGUSTO; POLIKARPOV, IGOR; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; APARICIO, RICARDO; IULEK, JORGE. Conformational variability of the stationary phase survival protein E from Xylella fastidiosa revealed by X-ray crystallography, small-angle X ray scattering studies, and normal mode analysis. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 85, n. 10, p. 1931-1943, OCT 2017. (12/51580-4, 08/55690-3, 05/03234-6, 04/02540-3, 11/15792-4, 06/52844-4, 01/07533-7)

SANTOS, CLELTON A.; TOLEDO, MARCELO A. S.; TRIVELLA, DANIELA B. B.; BELOTI, LILIAN L.; SCHNEIDER, DILAINE R. S.; SARAIVA, ANTONIO M.; CRUCELLO, ALINE; AZZONI, ADRIANO R.; SOUZA, ALESSANDRA A.; APARICIO, RICARDO; et al. Functional and structural studies of the disulfide isomerase DsbC from the plant pathogen Xylella fastidiosa reveals a redox-dependent oligomeric modulation in vitro. FEBS Journal, v. 279, n. 20, p. 3828-3843, OCT 2012. (01/07533-7, 08/55690-3)

SANTOS, CLELTON A.; JANISSEN, RICHARD; TOLEDO, MARCELO A. S.; BELOTI, LILIAN L.; AZZONI, ADRIANO R.; COTTA, MONICA A.; SOUZA, METE P.. Characterization of the TolB-Pal trans-envelope complex from Xylella fastidiosa reveals a dynamic and coordinated protein expression profile during the biofilm development process. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1854, n. 10, p. 10-pg., 2015-10-01. (09/53021-0, 08/55690-3, 12/51580-4, 01/07533-7)

FONSECA, EMANUELLA MARIA BARRETO; SCORSATO, VALERIA; DOS SANTOS, MARCELO LEITE; TOMAZINI, ATILIO; TADA, SUSELY FERRAZ SIQUEIRA; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; DE TOLEDO, MARCELO AUGUSTO SZYMANSKI; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; POLIKARPOV, IGOR; APARICIO, RICARDO. Crystal structure of a small heat-shock protein from Xylella fastidiosa reveals a distinct high-order structure. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 73, n. 4, p. 222-227, APR 1 2017. (08/55690-3, 02/01316-7, 08/52197-4, 06/52844-4, 01/07533-7)

SANTOS, CLELTON A.; JANISSEN, RICHARD; TOLEDO, MARCELO A. S.; BELOTI, LILIAN L.; AZZONI, ADRIANO R.; COTTA, MONICA A.; SOUZA, METE P.. Characterization of the TolB-Pal trans-envelope complex from Xylella fastidiosa reveals a dynamic and coordinated protein expression profile during the biofilm development process. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1854, n. 10, A, p. 1372-1381, OCT 2015. (01/07533-7, 08/55690-3, 12/51580-4)

SANTOS, CLELTON A.; SARAIVA, ANTONIO M.; TOLEDO, MARCELO A. S.; BELOTI, LILIAN L.; CRUCELLO, ALINE; FAVARO, MARIANNA T. P.; HORTA, MARIA A. C.; SANTIAGO, ANDRE S.; MENDES, JULIANO S.; SOUZA, ALESSANDRA A.; et al. Initial biochemical and functional characterization of a 5 `-nucleotidase from Xylella fastidiosa related to the human cytosolic 5 `-nucleotidase I. Microbial Pathogenesis, v. 59-60, p. 1-6, JUN-JUL 2013. (01/07533-7, 08/55690-3)

SANTOS, CLELTON A.; BELOTI, LILIAN L.; TOLEDO, MARCELO A. S.; CRUCELLO, ALINE; FAVARO, MARIANNA T. P.; MENDES, JULIANO S.; SANTIAGO, ANDRE S.; AZZONI, ADRIANO R.; SOUZA, ANETE P.. A novel protein refolding protocol for the solubilization and purification of recombinant peptidoglycan-associated lipoprotein from Xylella fastidiosa overexpressed in Escherichia coli. Protein Expression and Purification, v. 82, n. 2, p. 284-289, APR 2012. (01/07533-7, 08/55690-3)

SANTOS, CLELTON A.; SARAIVA, ANTONIO M.; TOLEDO, MARCELO A. S.; BELOTI, LILIAN L.; CRUCELLO, ALINE; FAVARO, MARIANNA T. P.; HORTA, MARIA A. C.; SANTIAGO, ANDRE S.; MENDES, JULIANO S.; SOUZA, ALESSANDRA A.; et al. Initial biochemical and functional characterization of a 5 '-nucleotidase from Xylella fastidiosa related to the human cytosolic 5 '-nucleotidase I. Microbial Pathogenesis, v. 59-60, p. 6-pg., 2013-06-01. (08/55690-3, 01/07533-7)

FONSECA, EMANUELLA MARIA BARRETO; SCORSATO, VALERIA; DOS SANTOS, MARCELO LEITE; TOMAZINI, ATILIO; TADA, SUSELY FERRAZ SIQUEIRA; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; DE TOLEDO, MARCELO AUGUSTO SZYMANSKI; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; POLIKARPOV, IGOR; APARICIO, RICARDO. Crystal structure of a small heat-shock protein from Xylella fastidiosa reveals a distinct high-order structure. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 73, p. 6-pg., 2017-04-01. (01/07533-7, 06/52844-4, 08/52197-4, 08/55690-3, 02/01316-7)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

SANTOS, Clelton Aparecido dos. Estudos estruturais e funcionais de proteínas relacionadas à patogenicidade de Xylella fastidiosa. 2013. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.