Retrotransposons das famílias scMaximus, scAle e scDel: desvendando as interações com o genoma da cana-de-açúcar

• Processo: 08/58243-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2009
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2013
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Marie-Anne Van Sluys
• Beneficiário: Guilherme Marcello Queiroga Cruz
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Retroelementos Genomas Cana-de-açúcar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana-De-Acucar | Genoma | Hopscothc | Maggy | Opie | Retrotransposon

Resumo

Elementos de transposição são unidades genômicas heterogêneas quanto ao modo de amplificação e expressão. Diferentes famílias de retotransposons em cana-de-açúcar apresentam variação no número de cópias assim como no perfil de expressão. Estas variações estão associadas às funções especificas desempenhada pelos elementos no genoma poliplóide desta espécie vegetal. O objetivo deste projeto é estabelecer uma correlação entre o padrão de amplificação e regulação de expressão dos retrotransposons das famílias Opie, Hopscotch e Maggy identificadas em cana-de-açúcar (Saccharum spp), que permitam entender diferenças observadas anteriormente. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE SETTA, NATHALIA; MONTEIRO-VITORELLO, CLAUDIA BARROS; METCALFE, CUSHLA JANE; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELO; DEL BEM, LUIZ EDUARDO; VICENTINI, RENATO; SILVEIRA NOGUEIRA, FABIO TEBALDI; CAMPOS, ROBERTA ALVARES; NUNES, SIDENY LIMA; GASPERAZZO TURRINI, PAULA CRISTINA; et al. Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. BMC Genomics, v. 15, JUN 30 2014. (09/51632-1, 10/05591-9, 08/54201-9, 09/09116-6, 11/05317-7, 08/52074-0, 09/09217-7, 08/58031-0, 08/52197-4, 08/58243-8, 08/52146-0)

CRUZ, GUILHERME M. Q.; METCALFE, CUSHLA J.; DE SETTA, NATHALIA; CRUZ, EDGAR A. O.; VIEIRA, ANDREIA PRATA; MEDINA, ROSARIO; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-Like Attachment Sites and Plastic CpG Islands: Landmarks of Diversity in Plant Del Retrotransposons. PLoS One, v. 9, n. 5, MAY 21 2014. (09/51632-1, 08/52074-0, 09/09217-7, 12/14610-2, 08/58243-8, 12/02671-7)

OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRES; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELLO; VIEIRA, ANDREIA PRATA; VAN SLUYS, MARIE-ANNE. Virus-like attachment sites as structural landmarks of plants retrotransposons. MOBILE DNA, v. 7, JUL 28 2016. (12/21064-4, 08/58243-8, 12/02671-7, 08/52074-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

CRUZ, Guilherme Marcello Queiroga. Desvendando as interações entre retrotransposons e genomas vegetais, com ênfase em cana-de-açúcar.. 2014. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) São Paulo.