Geração de banco de dados de microRNAs e identificação de seus genes-alvo em cana-de-açúcar

• Processo: 11/08363-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2011
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2011
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Fabio Tebaldi Silveira Nogueira
• Beneficiário: Ana Paula Rodrigues de Andrade
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 07/58289-5 - Isolamento e caracterização de microRNAs e seus genes alvo em cana-de-açúcar, AP.BIOEN.JP
• Assunto(s): Cana-de-açúcar Biologia computacional Banco de dados MicroRNAs
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Banco de dados | cana-de-açúcar | Genes-alvo | MicroRNAs | Bioinformática

Resumo

RNAs de baixo peso molecular (20-27 nucleotídeos, nt), incluindo microRNAs (miRNAs), regulam transcricionalmente ou pós-transcricionalmente a expressão de genes endógenos, modelando o transcriptoma e a produção de proteínas. MiRNAs são produzidos a partir de precursores longos e poliadenilados (pri-miRNAs), os quais formam estrutura secundária do tipo "hairpin". Os pri-miRNAs são transcritos pelos genes MIR e posteriormente processados por enzimas específicas, gerando o miRNA maduro (20-22 nt). Devido à quase perfeita complementaridade entre o miRNA maduro e o mRNA-alvo, o último pode ser identificado computacionalmente com sucesso. Em plantas, o miRNA maduro preferencialmente "guia" a clivagem do mRNA de genes-alvo, afetando diversos aspectos do desenvolvimento. O estudo de RNAs regulatórios em plantas ainda está em sua infância, principalmente em culturas de importância econômica, como a cana-de-açúcar. Portanto, a identificação e caracterização de microRNAs e seus genes-alvo poderão não somente contribuir para o melhor entendimento dos mecanismos associados ao desenvolvimento inicial de cana-de-açúcar, mas também ter potenciais aplicações no melhoramento vegetal.