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Identificação e análise funcional de proteínas de ligação a RNA associadas com o desenvolvimento do glioblastoma multiforme

Processo: 13/25483-4
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2014
Vigência (Término): 31 de março de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Pedro Alexandre Favoretto Galante
Beneficiário:Bruna Renata Silva Corrêa
Supervisor no Exterior: Luiz Otavio Ferraz Penalva
Instituição-sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Texas Health Science Center at San Antonio (UTHSCSA), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:13/07159-5 - Proteínas de ligação a RNA e variações pós-transcricionais: influência no desenvolvimento de glioblastomas multiformes, BP.DR
Assunto(s):Biologia computacional   Glioblastoma   Proteínas de ligação a RNA

Resumo

Glioblastoma multiforme (GBM) é um dos tipos de tumor cerebral mais agressivos, com uma sobrevida média dos pacientes de aproximadamente 15 meses após o diagnóstico. Essa baixa taxa de sobrevida é explicada pelo fato de que os tratamentos existentes não são capazes de impedir a recidiva do tumor. Assim, compreender aspectos básicos da biologia do GBM, como sua origem, desenvolvimento e resistência é fundamental para desenvolver terapias mais eficazes. Proteínas de ligação a RNA (RBPs) estão entre as moléculas envolvidas na origem e desenvolvimento do GBM. RBPs são moléculas cruciais para a regulação pós-transcricional da expressão gênica, estando envolvidas em diversos processos celulares como processamento de mRNAs e miRNAs, estabilidade, degradação, poliadenilação, splicing, entre outros. Alterações em seus níveis de expressão podem causar diversas modificações no proteoma das células, o que pode levar a estados patológicos, incluindo a tumorigênese. No presente projeto, propomos identificar RBPs relacionadas ao desenvolvimento e resistência do GBM ao tratamento. Primeiramente, iremos selecionar RBPs candidatas através de buscas em bancos de dados de expressão gênica; em seguida, em colaboração com o grupo do Dr. Penalva, iremos determinar o impacto das RBPs sobre expressas em GBM na proliferação, invasão, apoptose e sobrevivência. Os mRNAs alvos das três RBPs que apresentarem impacto mais proeminente nos ensaios funcionais serão determinados pela metodologia de iCLIP; sua relevância para o desenvolvimento do GBM será explorada por meio de metodologias de bioinformática, através do mapeamento dos genes alvo em processos biológicos e vias. Em conclusão, esperamos que a investigação dos elementos centrais que controlam a regulação pós-transcricional da expressão gênica em células tumorais, como as RBPs, possam revelar aspectos a respeito do desenvolvimento do GBM e abrir possibilidades de encontrar novos alvos terapêuticos. (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
VELASCO, MITZLI X.; KOSTI, ADAM; GUARDIA, GABRIELA D. A.; SANTOS, MARCIA C.; TEGGE, ALLISON; QIAO, MEI; CORREA, BRUNA R. S.; HERNANDEZ, GRECO; KOKOVAY, ERZSEBET; GALANTE, PEDRO A. F.; PENALVA, LUIZ O. F. Antagonism between the RNA-binding protein Musashi1 and miR-137 and its potential impact on neurogenesis and glioblastoma development. RNA, v. 25, n. 7, p. 768-782, JUL 2019. Citações Web of Science: 0.
CORREA, BRUNA R. S.; HU, JOANNA; PENALVA, LUIZ O. F.; SCHLEGEL, RICHARD; RIMM, DAVID L.; GALANTE, PEDRO A. F.; AGARWAL, SEEMA. Patient-derived conditionally reprogrammed cells maintain intra-tumor genetic heterogeneity. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, MAR 6 2018. Citações Web of Science: 8.
RAMOS CIRILO, PRISCILA DANIELE; DE SOUSA ANDRADE, LUCIANA NOGUEIRA; SILVA CORREA, BRUNA RENATA; QIAO, MEI; FURUYA, TATIANE KATSUE; CHAMMAS, ROGER; FERRAZ PENALVA, LUIZ OTAVIO. MicroRNA-195 acts as an anti-proliferative miRNA in human melanoma cells by targeting Prohibitin 1. BMC CANCER, v. 17, NOV 10 2017. Citações Web of Science: 9.
CORREA, BRUNA R.; DE ARAUJO, PATRICIA ROSA; QIAO, MEI; BURNS, SUZANNE C.; CHEN, CHEN; SCHLEGEL, RICHARD; AGARWAL, SEEMA; GALANTE, PEDRO A. F.; PENALVA, LUIZ O. F. Functional genomics analyses of RNA-binding proteins reveal the splicing regulator SNRPB as an oncogenic candidate in glioblastoma. Genome Biology, v. 17, JUN 10 2016. Citações Web of Science: 15.
SANTOS, MARCIA C. T.; TEGGE, ALLISON N.; CORREA, BRUNA R.; MAHESULA, SWETHA; KOHNKE, LUANA Q.; QIAO, MEI; FERREIRA, MARCO A. R.; KOKOVAY, ERZSEBET; PENALVA, LUIZ O. F. miR-124,-128, and-137 Orchestrate Neural Differentiation by Acting on Overlapping Gene Sets Containing a Highly Connected Transcription Factor Network. Stem Cells, v. 34, n. 1, p. 220-232, JAN 2016. Citações Web of Science: 34.

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