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Impacto de SNPs (single nucleotide polymorphisms) nos níveis de expressão do gene IRF6 em células de pacientes com fissura labial com ou sem fissura de palato

Processo: 11/04260-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2011
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Maria Rita dos Santos e Passos Bueno
Beneficiário:Carolina Malcher Amorim de Carvalho Silva
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Genética do desenvolvimento   Desenvolvimento crânio-facial   Fenda labial   Regulação da expressão gênica no desenvolvimento   Polimorfismo de um único nucleotídeo

Resumo

A fissura labial com ou sem fissura de palato (FL/P) é uma das malformações congênitas mais comuns, podendo estar associada a outras anomalias, ou ocorrer isoladamente (FL/P NS). A FL/P NS está associada a um modelo de herança multifatorial, com fatores genéticos e ambientais atuando na etiologia da desordem. Dentre os alelos de risco associados a predisposição à doença, destacam-se aqueles localizados no gene IRF6 (interferon regulatory factor 6). A maioria dos polimorfismos associados à FL/P NS encontra-se em regiões não-codificantes do gene, o que sugere um papel regulatório a essas variantes, seja regulando a atividade gênica a nível de transcrição ou pelo fato de estarem em desequilíbrio de ligação com outras variantes envolvidas neste tipo de regulação. Nosso objetivo é avaliar o impacto de SNPs localizados em regiões não-codificantes no padrão de expressão de IRF6 em células-tronco mesenquimais adultas oriundas de pacientes portadores de FL/P NS. Será realizada genotipagem desses indivíduos através do sistema TaqMan®, análise de expressão por PCR quantitativo em tempo real e para a análise dos dados será feita uma regressão linear entre o valor encontrado pela codificação do genótipo (em relação à frequência do alelo raro) e o nível de expressão normalizado, a partir da qual será obtido um valor de p (p-value). E por fim, para estimar os prováveis haplótipos, utilizaremos o programa PHASE v2.1.1. (AU)

Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SILVA, Carolina Malcher Amorim de Carvalho. Investigação do papel de SNVs (single nucleotide variants) na etiologia da fissura lábio-palatina não sindrômica. 2013. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências São Paulo.

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