| Processo: | 12/05392-1 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto |
| Data de Início da vigência: | 01 de fevereiro de 2013 |
| Data de Término da vigência: | 31 de janeiro de 2014 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos |
| Pesquisador responsável: | Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio |
| Beneficiário: | Diego Martinez Salvanha |
| Supervisor: | Nitin S. Baliga |
| Instituição Sede: | Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Institute for Systems Biology, Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 11/08104-4 - Ferramentas de integração para análise de SNP-array em variômica, BP.DD |
| Assunto(s): | Biologia computacional Polimorfismo de um único nucleotídeo Genomas |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Copy-number Variation (CNV) | modularização de software | Single-nucleotide polymorphism (SNP) | SNP-array | Variômica | Bioinformática |
Resumo Nesta era pós-genômica em que vivemos, muitas metodologias experimentais foram desenvolvidas e aperfeiçoadas, permitindo que novas abordagens pudessem ser aplicadas tanto a dados originais quanto a dados já existentes.Juntamente com a evolução e a especialização de tais técnicas surge a necessidade de lidar com novos tipos de dados, os quais possuem um enorme volume de informação. Dá-se então necessária novas abordagens sobre a perspectiva de processamento, análise e visualização de tais informações, para que o foco seja a compreensão e interpretação dos resultados obtidos através dos mesmos.Dentre todas as metodológicas experimentais existentes, SNP-array destaca-se no aspecto do estudo da Variômica, o estudo em escala global da variabilidade genética humana, onde este Projeto de Estágio propõe o desenvolvimento, a modularizarão e a implementação de metodologias para que o consolidado Software Gaggle Genome-Browser (GGB) passe a lidar com grande volume de dados gerados experimentalmente, de maneira transparente e automatizada para o usuário final: o pesquisador.Esse projeto também é de grande importância para o sucesso e usabilidade do Projeto de Doutorado Direto em andamento vinculado a esta solicitação, uma vez que tais implementações aqui propostas permitirão o uso avançado deste novo modulo a ser desenvolvido, permitindo que as posteriores implementações do Projeto Regular sejam facilitadas e integradas a essa poderosa ferramenta, afirmando assim a importância e a grandeza que essa oportunidade de interação proporcionará. (AU) | |
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