Ferramentas de integração para análise de SNP-array em variômica

Resumo

Os RNAs não-codificantes (ncRNAs) estão recebendo cada vez mais atenção por pertencerem a uma classe abundante de genes que podem atuar como elementos estruturais de regulação gênica. Avanços tecnológicos da Biologia Molecular têm auxiliado na descoberta e melhor compreensão do papel desempenhado por ncRNAs em diversos organismos. Com a disponibilidade de múltiplas fontes de informações genômicas e transcritômicas, o uso integrado desses dados juntamente com predições estruturais de RNAs podem prover evidências de possíveis novas moléculas de ncRNAs.A integração dessas classes de dados obtidas através de metodologias experimentais e in silico permite que o usuário utilize sua capacidade natural de reconhecer padrões visuais para identificação de possíveis trechos genômicos com características estruturais associadas a transcritos. Essa capacidade natural nos humanos pode então ser utilizada para uma melhor percepção do fenômeno biológico estudado. No presente projeto, propõe-se a aplicação de uma abordagem sistêmica, integrando múltiplas fontes de informações em larga-escala juntamente com predições estruturais de RNAs obtidas através de diversas metodologias in silico com o objetivo de identificar ncRNAs no extremófilo Halobacterum salinarum NRC-1. Para isso, foram implementadas ferramentas de integração e visualização de dados em larga-escala que permitem representar estruturas secundárias de RNAs. A utilização da ferramenta para visualização permitiu iniciar a reanotação do genoma deste organismo, identificando 51 putativos novos ncRNAs. Essa integração deve auxiliar a identificação de novas moléculas de ncRNAs com estruturas associadas, o que permitirá uma melhor compreensão das complexas redes regulatórias que estas biomoléculas estão envolvidas. (AU)