Estudo genômico de rearranjos cromossômicos aparentemente equilibrados em indivíduos com fenótipo anormal

• Processo: 12/10071-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2012
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Vera Lúcia Gil da Silva Lopes
• Beneficiário: Milena Simioni de Carvalho
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Desequilíbrio genômico | Hirbridação genômica em arrays | Rearranjo cromossômico aparentemente equilibrado | sequenciamento de nova geração | Citogenética e Biologia Molecular

Resumo

Os rearranjos cromossômicos aparentemente equilibrados (RAE) ocorrem em aproximadamente 1/2000 nascimentos. Com o advento das técnicas de hibridação genômica em arrays (aGH), detectou-se que 30 a 50% dos portadores destes rearranjos que possuíam fenótipo alterado apresentavam desequilíbrios genômicos, associados ou não aos pontos de quebra. Recentemente, alterações como inserções ou deleções de poucos pares de bases foram identificadas associadas aos pontos de quebra destes rearranjos por sequenciamento de nova geração (Next Generation Sequencing - NGS). O objetivo desta proposta é investigar alterações genômicas, relacionadas ou não aos pontos de quebra, em indivíduos com alterações fenotípicas portadores de RAE. Os pacientes iniciais são provenientes do Serviço de Genética Clínica da FCM/Unicamp, sendo possível incluir casos de outros centros de atendimento do Brasil. Os casos selecionados com RAE por cariótipo, serão primeiramente analisados pela técnica de aGH. Encontradas alterações genômicas causativas, os resultados serão confirmados por FISH do propósito e, se necessário, dos genitores. Não encontradas alterações genômicas causativas, os cromossomos envolvidos nos rearranjos serão microdissecados e suas sequências analisadas por NGS com a plataforma Illumina Genome Analyzer para se investigar alterações em nível de par de bases. Toda infra-estrutura laboratorial necessária está disponível na Unicamp e no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron. Espera-se que os resultados deste projeto contribuam para o entendimento dos mecanismos genômicos que resultam em alterações fenotípicas em RAE. Além disso, serão incorporadas ferramentas diagnosticas modernas que permitirão o desenvolvimento de uma nova linha de pesquisa no Departamento de Genética Médica da FCM/Unicamp.

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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