Estudo genômico de rearranjos cromossômicos aparentemente equilibrados em indivíduos com fenótipo anormal

• Processo: 12/10071-0
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de outubro de 2012
• Vigência (Término): 30 de setembro de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Vera Lúcia Gil da Silva Lopes
• Beneficiário: Milena Simioni de Carvalho
• Instituição-sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração

Resumo

Os rearranjos cromossômicos aparentemente equilibrados (RAE) ocorrem em aproximadamente 1/2000 nascimentos. Com o advento das técnicas de hibridação genômica em arrays (aGH), detectou-se que 30 a 50% dos portadores destes rearranjos que possuíam fenótipo alterado apresentavam desequilíbrios genômicos, associados ou não aos pontos de quebra. Recentemente, alterações como inserções ou deleções de poucos pares de bases foram identificadas associadas aos pontos de quebra destes rearranjos por sequenciamento de nova geração (Next Generation Sequencing - NGS). O objetivo desta proposta é investigar alterações genômicas, relacionadas ou não aos pontos de quebra, em indivíduos com alterações fenotípicas portadores de RAE. Os pacientes iniciais são provenientes do Serviço de Genética Clínica da FCM/Unicamp, sendo possível incluir casos de outros centros de atendimento do Brasil. Os casos selecionados com RAE por cariótipo, serão primeiramente analisados pela técnica de aGH. Encontradas alterações genômicas causativas, os resultados serão confirmados por FISH do propósito e, se necessário, dos genitores. Não encontradas alterações genômicas causativas, os cromossomos envolvidos nos rearranjos serão microdissecados e suas sequências analisadas por NGS com a plataforma Illumina Genome Analyzer para se investigar alterações em nível de par de bases. Toda infra-estrutura laboratorial necessária está disponível na Unicamp e no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron. Espera-se que os resultados deste projeto contribuam para o entendimento dos mecanismos genômicos que resultam em alterações fenotípicas em RAE. Além disso, serão incorporadas ferramentas diagnosticas modernas que permitirão o desenvolvimento de uma nova linha de pesquisa no Departamento de Genética Médica da FCM/Unicamp.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SIMIONI, MILENA; ARTIGUENAVE, FRANCOIS; MEYER, VINCENT; SGARDIOLI, ILARIA C.; VIGUETTI-CAMPOS, NILMA L.; MONLLEO, ISABELLA LOPES; MACIEL-GUERRA, ANDREA T.; STEINER, CARLOS E.; GIL-DA-SILVA-LOPES, VERA L. Genomic Investigation of Balanced Chromosomal Rearrangements in Patients with Abnormal Phenotypes. MOLECULAR SYNDROMOLOGY, v. 8, n. 4, p. 187-194, 2017. Citações Web of Science: 1.

FONTES, MARSHALL I. B.; SANTOS, ANA P.; MOLCK, MIRIAM C.; SIMIONI, MILENA; NASCIMENTO, DIOGO L. L.; ANDRADE, ANA K. M.; ROSENBERG, CARLA; KREPISCHI, ANA C. V.; APPENZELLER, SIMONE; MONLLEO, ISABELLA L.; GIL-DA-SILVA-LOPES, VERA LUCIA. Genotype-Phenotype Correlation of 16p13.3 Terminal Duplication and 22q13.33 Deletion: Natural History of a Patient and Review of the Literature. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A, v. 170, n. 3, p. 766-772, MAR 2016. Citações Web of Science: 3.

SIMIONI, MILENA; STEINER, CARLOS EDUARDO; GIL-DA-SILVA-LOPES, VERA LUCIA. De novo double reciprocal translocations in addition to partial monosomy at another chromosome: A very rare case. Gene, v. 573, n. 1, p. 166-170, NOV 15 2015. Citações Web of Science: 4.