Interações moleculares no mecanismo de ação da proteína P7 do vírus da Hepatite C e da galectina-4 humana

• Processo: 12/20358-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 10 de fevereiro de 2013
• Data de Término da vigência: 09 de fevereiro de 2014
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Antonio José da Costa Filho
• Beneficiário: Patricia Suemy Kumagai
• Supervisor: Anthony Watts
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Oxford, Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 11/21767-2 - Interações moleculares no mecanismo de ação da galectina-4 humana, BP.DD
• Assunto(s): Galectina 4 Proteínas Vírus da hepatite C
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: espectroscopias | galectina | Gpcr | interação com ligantes | interação com membranas | Espectroscopia de moléculas biológicas

Resumo

O presente projeto de pesquisa visa descrever as atividades a serem realizadas pela aluna Patricia Suemy Kumagai em estágio de doutorado junto à University of Oxford e sob a supervisão do Prof. Dr. Anthony Watts. No referido estágio pretende-se estudar duas proteínas que tem em sua interação com membranas biológicas o ponto de intersecção de sua atividade. A primeira é a proteína p7 do vírus da Hepatite C, participante da formação de canais iônicos durante o ciclo de vida do vírus e que é alvo de estudos do grupo do Prof. Watts. Neste caso, interessa investigar a organização estrutural de suas hélices quando inserida em modelos de membrana, assim como mapear e reconhecer sítios de ligação de inibidores de sua atividade. O segundo sistema de interesse envolve a galectina 4 humana, proteína em estudo no projeto de doutorado regular da aluna, e para a qual buscamos informações que ajudem a elucidar seus mecanismos de interação com açúcares diversos e com modelos de membrana. Em ambos os casos, os estudos compreenderão, basicamente, métodos em Ressonância Magnética Nuclear (RMN) que são especialidade do grupo no exterior. O Prof. Watts conta com completa infraestrutura tanto de RMN quanto de preparação de amostras biológicas. No caso da galectina 4, pretendemos, ainda, realizar experimentos de dicroísmo circular com radiação sincrotron (SRCD) para o que contamos com a colaboração da Prof(a). Dr.(a) Bonnie Wallace (University of London). Com tais experimentos, objetivamos complementar os dados obtidos até o momento em busca da identificação de mudanças conformacionais na proteína quando na presença de açúcares. O projeto permitirá, portanto, que a aluna estenda sua formação, incluindo agora novas metodologias (RMN e SRCD) e novos sistemas de trabalho (proteína integrais de membrana). (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DIJKMAN, PATRICIA M.; MUNOZ-GARCIA, JUAN C.; LAVINGTON, STEVEN R.; KUMAGAI, PATRICIA SUEMY; DOS REIS, I, ROSANA; YIN, DANIEL; STANSFELD, PHILLIP J.; COSTA-FILHO, ANTONIO JOSE; WATTS, ANTHONY. Conformational dynamics of a G protein-coupled receptor helix 8 in lipid membranes. SCIENCE ADVANCES, v. 6, n. 33, AUG 2020. (10/17662-8, 12/20358-4, 11/21767-2)