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Triagem de marcadores moleculares informativos para estudos evolutivos envolvendo espécies do gênero Cereus (Família Cactaceae; Tribo Cereeae)

Processo: 13/07211-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de junho de 2013
Vigência (Término): 30 de novembro de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Fernando de Faria Franco
Beneficiário:Monique Romeiro Brito
Instituição-sede: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brasil
Assunto(s):Filogenia   Marcador molecular   Bacillus cereus   Estudo comparativo

Resumo

O gênero Cereus (família Cactaceae, tribo Cereeae) apresenta cerca de trinta espécies na América do Sul. Estas espécies estão divididas em quatro subgêneros, sendo que três subgêneros (Ebneria, Mirabella e Cereus) estão presentes no Brasil. Estudos evolutivos inter e intra-específicos usando marcadores moleculares nas espécies de Cereus são escassos. Recentemente, dados do espaçador intergênico plastidial trnS-trnG foram informativos para o estabelecimento de relações filogenéticas entre espécies desse gênero, bem como para identificação de grupos populacionais de C. fernambucensis (subgênero Cereus). No entanto, apenas com esse marcador molecular não foi possível identificar as relações filogenéticas entre espécies de divergência mais recente desse grupo. Nesse sentido, o presente projeto tem como objetivo identificar segmentos plastidiais e nucleares potencialmente informativos para estudos filogenéticos e populacionais em Cereus. Para tanto, seis marcadores moleculares selecionados em literatura serão testados no presente projeto, sendo segmentos plastidiais (rpS16, rpL16, trnK-matK, trnL-trnF, matK) e um segmento nuclear (fragmento intrônico do gene LEAFY). A análise da variabilidade nestes marcadores seguirá três etapas, sendo a primeira comparando espécies de Cereus de subgêneros distintos e alocadas em clados distintos da filogenia do grupo. Havendo variação nesse nível, serão comparadas espécies do subgênero Cereus proximamente relacionadas filogeneticamente. Finalmente, havendo variação no segundo nível de análise, o marcador será comparado entre populações de C. fernambucensis.(AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ROMEIRO-BRITO, MONIQUE; MORAES, EVANDRO M.; TAYLOR, NIGEL P.; ZAPPI, DANIELA C.; FRANCO, FERNANDO F. LINEAGE-SPECIFIC EVOLUTIONARY RATE IN PLANTS: CONTRIBUTIONS OF A SCREENING FOR CEREUS (CACTACEAE). APPLICATIONS IN PLANT SCIENCES, v. 4, n. 1 JAN 2016. Citações Web of Science: 8.

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