| Processo: | 13/09391-2 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 12 de setembro de 2013 |
| Data de Término da vigência: | 11 de dezembro de 2013 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal |
| Pesquisador responsável: | Marie-Anne Van Sluys |
| Beneficiário: | Cushla J Metcalfe |
| Supervisor: | Karen Aitken |
| Instituição Sede: | Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | CSIRO Plant Industry, Austrália |
| Vinculado à bolsa: | 09/09217-7 - Estudos sobre a organização do genoma de cana de açúcar e expressão gênica associada a presença de elementos de transposição, BP.PD |
| Assunto(s): | Genética molecular Reação em cadeia da polimerase em tempo real Cana-de-açúcar |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | BioEn | breeding | Real-Time PCR | retroelements | sugarcane | transposable elements | genetica molecular |
Resumo A cana-de-açúcar é uma cultura importante tanto no Brasil quanto na Austrália. Cultivares modernas possuem genomas grandes e altamente poliplóides, estimando-se que eles possuem 8-10 alelos, dependendo do cultivar. Para a maioria dos cultivares, no entanto, o tamanho exato do genoma é desconhecido. Portanto, a cana-de-açúcar apresenta dificuldades particulares no desenvolvimento de marcadores para programas de melhoramento. O método de Polimorfismo de Inserção Baseado em Retrotransposição (RBIP) é um método baseado em PCR para determinar a presença de uma cópia específica de um retrotransposons-LTR (Repetição Terminal Longa) (um tipo de elemento transponível). Esta técnica tem sido utilizada com sucesso em outros genomas de gramíneas como um sistema de DNA marcador, mas, porque é baseado em PCR, podem ser utilizados somente em organismos diplóides. Nós temos desenvolvido um sistema baseado no método RBIP combinado com PCR quantitativa para estimar a proporção de alelos com os retrotransposons-LTR presente num determinado locus para criar um perfil de retrotransposon-LTR. Os estudos preliminares sugerem que os resultados são consistentes ao longo das 14-16 repetições, uma diferença de dez vezes no modelo, o que não dá resultados significativamente diferentes, e os padrões da razão entre o número de inserções em três loci é suficiente viável para distinguir diferentes cultivares. (AU) | |
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