Avaliação das modificações pós traducionais de histonas em linhagens celulares de tumor colorretal com diferentes padrões de metilação do DNA

• Processo: 13/08330-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2013
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2015
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Pesquisador responsável: Raphael Bessa Parmigiani
• Beneficiário: Nayara Trevisan dos Santos Doimo
• Instituição Sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Neoplasias colorretais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: alterações epigenéticas | câncer colorretal | Cimp | modificações de histonas | Alterações epigenéticas e câncer colorretal

Resumo

O câncer colorretal (CCR) é uma das neoplasias malignas mais comumente diagnosticadas no mundo. O CCR era considerado uma doença predominantemente genética, caracterizada pelo acúmulo de alterações genéticas que conferem vantagens proliferativas para um determinado clone celular. Entretanto, estudos subsequentes mostraram que mecanismos epigenéticos também podem estar desregulados em tumor, e levar à formação do mesmo. A importância do papel das alterações epigenéticas na patogênese do CCR foi corroborado através da identificação do fenótipo metilador de ilhas CpG (CIMP), caracterizado pela alta frequência de metilação de diferentes regiões do genoma, e identificado em 20 a 30 % das amostras de CCR. Considerando-se que a metilação do DNA é modulada coordenadamente com as outras alterações epigenéticas, pode-se inferir que além deste mecanismo, os tumores com este fenótipo também apresentem outros processos epigenéticos desregulados. As modificações de histonas, por exemplo, também podem contribuir na formação e evolução de tumores, devido à sua atuação na regulação de genes envolvidos em diferentes processos celulares, como transcrição, replicação e reparo de DNA. Embora amostras de CCR tenham sido amplamente estudadas com relação à metilação do DNA, o mesmo não ocorreu com relação às modificações de histonas. Assim, o presente trabalho pretende caracterizar o perfil de modificações de histonas em linhagens celulares de tumor colorretal e correlacioná-lo aos diferentes subgrupos de CIMP. Esta caracterização será realizada a partir da técnica de imunoprecipitação de cromatina seguida de sequenciamento em larga escala (ChIP-Seq). Desse modo, será possível desvendar diferenças entre os perfis de modificações de histonas em linhagens celulares pertencentes aos diferentes subgrupos de CIMP. Mais do que isso, será possível corroborar o importante papel de outras alterações epigenéticas, além da metilação do DNA, no desenvolvimento e na biologia do CCR.