Genotipagem do Paracoccidioides brasiliensis de diferentes amostras de pacientes atendidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu

• Processo: 13/24877-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2014
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Luciane Alarcão Dias-Melicio
• Beneficiário: Luciana Bonome Zeminian de Oliveira
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FMB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
• Assunto(s): Paracoccidioidomicose Técnicas de genotipagem Paracoccidioides brasiliensis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Espécies crípticas | Genotipagem | Paracoccidioides brasiliensis | paracoccidioidomicose | Genética do Paracoccidioides brasiliensis

Resumo

A paracoccidioidomicose a é uma infecção fúngica sistêmica e seu agente etiológico é o Paracoccidioides brasiliensis (P. brasiliensis). Através da análise por concordância de genealogia de genes foi possível detectar essas três espécies crípticas: S1, PS2, e PS3. A partir de análises filogenéticas de multilocus, demonstraram a existência de um grupo geneticamente bastante divergente de isolados de P. brasiliensis do complexo S1, PS2 e PS3, o Pb01-like, proveniente da região centro-oeste do Brasil que constitui na verdade uma quarta espécie críptica, o Paracoccidioides lutzii. A genotipagem de amostras clínicas do gênero Paracoccidoides pode contribuir para estudos epidemiológicos e clínicos da Paracoccidioidomicose. Dessa forma, com todo conhecimento acumulado até agora, torna-se extremamente interessante a avaliação das diferentes espécies em amostras coletadas de pacientes atendidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu. Este estudo tem como objetivo geral a avaliação da especiação do Paracoccidioides em amostras de tecidos incluídas em parafina de pacientes atendidos na Faculdade de Medicina de Botucatu, UNESP - Campus Botucatu. Para esse fim, propomos a extração de DNA das amostras incluídas em parafina e em seguida, uma reação de NESTED PCR e sequenciamento da região ITS do Paracoccidioides para diferenciar P. brasiliensis de P. lutzii. Então para a especiação dos isolados S1, PS2 e PS3 propomos uma reação de PCR Real Time pelo método Taqman dos genes gp43 e ARF e um posterior sequenciamento das mesmas regiões para confirmação dos dados. As sequências serão analisadas e alinhadas com o programa MEGA 5.2 (Kumar et al, 2012) usando o algoritmo de alinhamento MUSCLE (Edgar, 2004). As sequências serão comparadas com as sequências depositadas no GenBank. Será calculado o melhor modelo evolutivo para as sequências e construídas árvores filogenéticas pelos métodos de NeighborJoining, Máxima Parcimônia e Máxima verossimilhança, utilizando como método de suporte estatístico 1000 réplicas de bootstrap.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE OLIVEIRA, LUCIANA BONOME ZEMINIAN; DELLA COLETTA, AMANDA MANOEL; GARDIZANI, TAIANE PRISCILA; GARCES, HANS GARCIA; BAGAGLI, EDUARDO; TRILLES, LUCIANA; BARROZO, LIGIA VIZEU; MARQUES, SILVIO DE ALENCAR; FAVERI, JULIO DE; DIAS-MELICIO, LUCIANE ALARCAO. Molecular Phylogenetic Analysis of Paracoccidioides Species Complex Present in Paracoccidioidomycosis Patient Tissue Samples. MICROORGANISMS, v. 11, n. 3, p. 13-pg., 2023-03-01. (13/24877-9)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

OLIVEIRA, Luciana Bonome Zeminian de. Genotipagem do Paracoccidioides brasiliensis de diferentes amostras de pacientes atendidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu. 2018. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Medicina. Botucatu Botucatu.