Deleção de genes envolvidos na via de secreção de proteínas em Aspergillus nidulans

• Processo: 15/00660-6
• Linha de fomento: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Vigência (Início): 20 de agosto de 2015
• Vigência (Término): 19 de junho de 2016
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: André Ricardo de Lima Damasio
• Beneficiário: Mariane Paludetti Zubieta
• Supervisor no Exterior: Rolf Alexander Prade
• Instituição-sede: Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais (CNPEM). Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações (Brasil). Campinas , SP, Brasil
• Local de pesquisa : Oklahoma State University, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 14/15403-6 - Aspergillus nidulans como modelo para manipulação de genes envolvidos no processo de "Unfolded Protein Response", BP.DR
• Assunto(s): Resposta a proteínas não dobradas Retículo endoplasmático Aspergillus nidulans

Resumo

Em eucariotos, unfolded protein response (UPR) regula positivamente genes responsáveis por restaurar a homeostase no retículo endoplasmático (RE) durante o acúmulo de proteínas desenoveladas ou enoveladas incorretamente. Condições que sobrecarregam o RE com estas proteínas, incluem estresses ambientais, alterações no estado redox do RE, e a expressão de proteínas heterólogas em sistemas biológicos como fungos filamentosos. Os genes envolvidos em UPR foram previamente estudados e utilizados como ferramenta para aumentar a secreção de proteínas em sistemas heterólogos, no entanto o número de resultados é limitado. Devido à complexa rede regulatória envolvida em UPR, pode ser difícil selecionar genes alvo adequados para o melhoramento da via secretora. Em células fúngicas, UPR regula muitos genes que estão envolvidos em vários processos, tais como a via de secreção, glicosilação, ERAD (Endoplasmic-Reticulum-Associated Protein Degradation) e enovelamento de proteínas. Portanto, o objetivo central deste projeto é deletar genes relacionados a UPR, cuidadosamente selecionados a partir de dados de RNA seq, em Aspergillus nidulans e observar o efeito destas deleções sobre os níveis de secreção de proteínas heterólogas. Os dados de RNAseq foram obtidos a partir do cultivo de A. nidulans na presença de reagentes que induzem stress de RE como tunicamicina (Tm) e ditiotreitol (DTT). (AU)