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Avaliação do arranjo de SNPs de 65K na linhagem de corrida da raça Quarto de Milha e eficiência da imputação entre os arranjos de 54 e 65K

Processo: 15/06347-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de julho de 2015
Vigência (Término): 30 de junho de 2016
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Rogério Abdallah Curi
Beneficiário:Gabriel Mantelato Rogatto
Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Assunto(s):Melhoramento genético animal   Polimorfismo de um único nucleotídeo   Genótipo   Cavalo Quarto-de-Milha
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:cavalo | Equine SNP50 BeadChip | Equine SNP70 BeadChip | Gwas | Melhoramento Genético de Equinos

Resumo

Dentro da raça Quarto de Milha, diferentes objetivos de seleção levaram à formação de linhagens com distintas habilidades, entre as quais as de: corrida, conformação e trabalho. Com menor efetivo, porém com grande representatividade econômica, o primeiro segmento apresenta melhor desempenho em corridas de curtas distâncias do que qualquer outra raça de equinos, sendo os mais velozes cavalos do mundo e um dos mais velozes dentre todos os animais. A linhagem de trabalho destina-se às provas de caráter funcional, explorando habilidades como agilidade e obediência, características consideradas de grande importância no manejo do gado a campo. Projetado para permitir a identificação de SNPs e genes que contribuem para características de interesse nas principais raças de equinos criadas atualmente no mundo, o Equine SNP50 BeadChip (Illumina Inc., EUA) constituiu, com cerca de 54.000 SNPs (54K), poderosa plataforma para a seleção e o melhoramento genético da espécie. Já em sua segunda geração, o novo SNP chip equino (Equine SNP70 BeadChip; Illumina Inc., EUA) possui aproximadamente 65 mil SNPs (65K), dos quais 19 mil são novos marcadores e 45 mil foram validados no Equine SNP50 BeadChip. Esta pesquisa terá como objetivos: (1) avaliar, principalmente, por meio da MAF (minor allele frequency) a perda de SNPs informativos e, consequentemente, o potencial de aplicação Equine SNP70 BeadChip (65K) em equinos de corrida da raça Quarto de Milha; (2) avaliar a eficiência da imputação de genótipos entre o Equine SNP50 BeadChip (54K) e o Equine SNP70 BeadChip (65K) utilizando animais de corrida e de trabalho da raça Quarto de Milha.

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