| Processo: | 16/05817-3 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de novembro de 2016 |
| Data de Término da vigência: | 31 de outubro de 2017 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos |
| Pesquisador responsável: | Juliana Pfrimer Falcão |
| Beneficiário: | Fábio Campioni |
| Supervisor: | Marc William Allard |
| Instituição Sede: | Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | U.S. Food and Drug Administration (FDA), Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 13/25191-3 - Análise fenotípica e sequenciamento do transcriptoma e genoma em linhagens de Salmonella Enteritidis isoladas no período pré e pós-pandemia no Brasil, BP.PD |
| Assunto(s): | Biologia computacional Epidemiologia Virulência Infecções por Salmonella Salmonella enteritidis |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | análise de bioinformática | Pandemia | salmonella enteritidis | sequenciamento | Virulência | Epidemiologia |
Resumo A doença decorrente da infecção por Salmonella é um dos maiores problemas de saúde no mundo em termos de morbidade e mortalidade. Entre as sorovariedades de Salmonella enterica, a Enteritidis (S. Enteritidis) compreende linhagens que possuem habilidade especializada de colonizar o trato reprodutivo de aves e contaminar componentes internos de ovos, o que possibilitou que S. Enteritidis se tornasse a mais comum das sorovariedades de Salmonella spp. causadoras de doenças em humanos. Apesar de não se saber ao certo os motivos que levaram a isso, acredita-se que um clone epidêmico e mais virulento tenha sido inserido no país pelo intercâmbio comercial de aves com outros países. Esse projeto tem como objetivo analisar comparativamente através de sequenciamento do genoma total, linhagens de Salmonella Enteritidis isoladas ao longo de 45 anos no Brasil, o que inclui linhagens isoladas no período pré e pós-pandemia no Brasil. Para isso, serão estudadas 208 linhagens de S. Enteritidis, sendo 24 linhagens isoladas no período pré-pandemia (1968-1992) e 184 linhagens isoladas no período pós-pandemia (1993-2013) em vários locais do Brasil. Todas as 208 S. Enteritidis terão seu genoma completo sequenciado utilizando-se a plataforma Nextseq da Illumina durante o estágio a ser realizado no exterior no Food and Drugs Administration e, a análise dos dados, será realizada sob a supervisão do prof. Dr. Daniel Janies da University of North Caroline. Em conjunto, os resultados a serem obtidos deverão contribuir para uma melhor caracterização de S. Enteritidis, bem como fornecerão informações sobre as genômicas entre linhagens isoladas em período pré e pós-pandemia no país, o que poderá colaborar na elucidação dos motivos do início da pandemia no Brasil, bem como, poderá fornecer dados para outros estudos sobre a emergência da sorovariedade Enteritidis como a mais prevalente em vários locais do mundo. (AU) | |
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