Avaliação de riboswitch theo/metE para silenciamento gênico em Xanthomonas citri

• Processo: 16/18519-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Henrique Ferreira
• Beneficiário: Danilo Bueno
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Assunto(s): Cancro (doença de planta) Expressão gênica Fitopatologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cancro cítrico | expressão gênica | parada de transcrição | fitopatologia

Resumo

Estudos genéticos em qualquer organismo requerem ferramentas eficazes para se alterar a expressão gênica. Dentre estas, riboswitches oferecem uma alternativa bastante atrativa para modulação da expressão de genes de interesse, onde é possível ligar e desligar tais genes sem a remoção dos mesmos dos genomas. Esta alternativa permite o estudo direto de um gene e a avaliação da sua falta (quando desligado ou "OFF"), bem como permite o reestabelecimento do selvagem sem a necessidade da complementação padrão (estado "ON"). Na busca por melhores condições de caracterização genética e do desenvolvimento de ferramentas dedicadas para estudos de genes essenciais ou de difícil caracterização em Xac, pretendemos avaliar o uso de um sistema de riboswitch (theo/metE) para o controle de expressão gênica nesta bactéria. A caracterização propriamente dita será feita alterando-se a expressão de parB. A proteína ParB opera em segregação cromossômica e sua perturbação pode levar a fenótipo de filamentação e erros de divisão em Xac (Ucci et al., 2014), que são de fácil identificação. Adicionalmente, o sistema riboswitch (theo/metE) será também utilizado para alterar a expressão do gene amy em Xac, responsável pela produção da proteína ±-amilase que degrada amido. O sucesso desta estratégia permitira o silenciamento de genes essenciais em Xac e de difícil caracterização com métodos de deleção convencionais. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BUENO, DANILO; PEDROLLI, DANIELLE B.; MARTINS, PAULA M. M.; BOCCHINI, DANIELA A.; MORAES, KAREN C. M.; FACINCANI, AGDA P.; FERRO, JESUS A.; VARANI, ALESSANDRO M.; PENA, MICHELLE M.; FERREIRA, HENRIQUE. Riboswitch theo/metE as a Transcription Regulation Tool for Xanthomonas citri subsp. citri. MICROORGANISMS, v. 9, n. 2, FEB 2021. (16/18519-0, 15/50162-2, 14/50880-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

BUENO, Danilo. Avaliação de riboswitch theo/metE para silenciamento gênico em Xanthomonas citri. 2018. Dissertação de Mestrado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Instituto de Biociências. Rio Claro Rio Claro.