Análise comparativa computacional de transfectante de Leishmania nocaute para PRMT7: transcriptoma e metilproteoma

• Processo: 17/14765-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2017
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Acordo de Cooperação: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
• Pesquisador responsável: Angela Kaysel Cruz
• Beneficiário: Rubens Daniel Miserani Magalhães
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 15/13618-8 - Regulando trans-reguladores: investigação da via molecular de PRMT7 como regulador epigenético da virulência em Leishmania, AP.TEM
• Assunto(s): Leishmania Transcriptoma Expressão gênica Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Transcriptoma | Genética Molecular de Leishmania

Resumo

O estudo proposto requer a integração dos dados de análise de expressão gênica em diferentes níveis, com análise fenotípica de parasitas mutantes gerados nesta investigação. As comparações devem incluir estudos transcriptômicos e proteômicos e a análise dos complexos proteína-RNA nos diferentes mutantes gerados, ao longo do ciclo de vida do parasita. A avaliação de possíveis sequências de resíduos de aminoácidos conservados alvos da metilação por PRMT e a comparação de possíveis motivos de RNA preferencialmente associados a RBPs, metilados ou não, dependem predominantemente da participação de um especialista em bioinformática. Os dados gerados devem ser armazenados corretamente e o seu resgate e integração devem ser facilitados. Portanto, o desenvolvimento e integração de ferramentas computacionais que permitem a análise de expressão gênica são essenciais para a otimização da informação fornecida devido grande volume de dados gerados. (AU)