Abordagem de sequenciamento do genoma completo para estudar Salmonella enterica multirresistentes isoladas de abatedouros do Brasil

• Processo: 17/15967-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2017
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Ciência e Tecnologia de Alimentos - Ciência de Alimentos
• Pesquisador responsável: Mariza Landgraf
• Beneficiário: Daniel Farias Marinho Do Monte
• Supervisor: Paula J. Fedorka-Cray
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: North Carolina State University (NC State), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 16/03044-7 - Diversidade genética, genes de virulência e resistência antimicrobiana de isolados de Salmonella spp. provenientes de abatedouros de frango, BP.DR
• Assunto(s): Microbiologia Salmonella enterica Resistência a medicamentos Análise de sequência de DNA Biologia molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Multi-drug resistant Salmonella | Whole Genome Sequencing | Microbiologia molecular

Resumo

A caracterização de patógenos transmitidos por alimentos vem sofrendo alterações ao longo do tempo, embora sistemas de tipagem tradicionais baseados em características fenotípicas como antibiograma, biotipo e serotipos ainda sejam amplamente utilizados. O advento da biologia molecular e o uso de técnicas baseadas na análise do DNA revolucionaram o campo da epidemiologia e da caracterização de patógenos e o sequenciamento do genoma total (WGS) permite aos cientistas e indústrias gerar dados rapidamente para resolver problemas. A bioinformática pode ser usada como uma ferramenta útil na investigação epidemiológica de isolados de Salmonella distribuídos na cadeia de produção de aves e esse patógeno pode agora ser examinado "in silico" para a presença de resistência antimicrobiana (AMR) e de genes de virulência imediatamente após o sequenciamento, enquanto que o teste de AMR tradicional além de ser demorado é caro. Considerando esses aspectos, o presente projeto objetiva a investigação da resistência antimicrobiana, virulência e diversidade genotípica para serovares de Salmonella importantes na produção de frango aplicando abordagem de sequenciamento de genoma total. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MONTE, DANIEL F. .; LINCOPAN, NILTON; BERMAN, HANNA; CERDEIRA, LOUISE; KEELARA, SHIVARAMU; THAKUR, SIDDHARTHA; FEDORKA-CRAY, PAULA J.; LANDGRAF, MARIZA. Genomic Features of High-Priority Salmonella enterica Serovars Circulating in the Food Production Chain, Brazil, 2000-2016. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, JUL 30 2019. (13/07914-8, 17/15967-5, 16/03044-7)

MONTE, DANIEL F. M.; NETHERY, MATTHEW A.; BARRANGOU, RODOLPHE; LANDGRAF, MARIZA; FEDORKA-CRAY, PAULA J.. Whole-genome sequencing analysis and CRISPR genotyping of rare antibiotic-resistant Salmonella enterica serovars isolated from food and related sources. FOOD MICROBIOLOGY, v. 93, p. 9-pg., 2021-02-01. (13/07914-8, 17/15967-5)

MONTE, DANIEL F.; LINCOPAN, NILTON; FEDORKA-CRAY, PAULA J.; LANDGRAF, MARIZA. Current insights on high priority antibiotic-resistant Salmonella enterica in food and foodstuffs: a review. CURRENT OPINION IN FOOD SCIENCE, v. 26, p. 12-pg., 2019-04-01. (16/03044-7, 13/07914-8, 17/15967-5)

MONTE, DANIEL F.; LINCOPAN, NILTON; CERDEIRA, LOUISE; FEDORKA-CRAY, PAULA J.; LANDGRAF, MARIZA. Early Dissemination of qnrE1 in Salmonella enterica Serovar Typhimurium from Livestock in South America. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 63, n. 9, SEP 2019. (13/07914-8, 17/15967-5, 16/03044-7)

MONTE, DANIEL F. M.; NETHERY, MATTHEW A.; BERMAN, HANNA; KEELARA, SHIVARAMU; LINCOPAN, NILTON; FEDORKA-CRAY, PAULA J.; BARRANGOU, RODOLPHE; LANDGRAF, MARIZA. Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats Genotyping of Multidrug-Resistant Salmonella Heidelberg Strains Isolated From the Poultry Production Chain Across Brazil. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 13, p. 14-pg., 2022-06-17. (17/15967-5, 16/03044-7, 13/07914-8)