Desenvolvimento e teste de protocolos para metabarcode de DNA ambiental para o levantamento de anfíbios de serrapilheira na Mata Atlântica

• Processo: 17/20204-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2018
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia
• Pesquisador responsável: Célio Fernando Baptista Haddad
• Beneficiário: Carla Martins Lopes
• Supervisor: Pierre Taberlet
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Laboratoire D'Écologie Alpine, França
• Vinculado à bolsa: 16/14054-3 - DNA ambiental aplicado a estudos de monitoramento e conservação de anfíbios anuros na Mata Atlântica, BP.PD
• Assunto(s): Anfíbios Degradação ambiental Serrapilheira Mata Atlântica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anfíbios | DNA ambiental | DNA metabarcodes | Mata Atlântica | serrapilheira | DNA ambiental

Resumo

O Brasil tem uma das maiores diversidades de anfíbios do mundo, com aproximadamente 1000 espécies descritas. Os anfíbios são bastante sensíveis à degradação ambiental, enfrentando sérios problemas de declínios populacionais, extinções locais, e até mesmo extinção de espécies. Na Mata Atlântica, algumas espécies de anfíbios associadas à camada de serrapilheira não são registradas há muitos anos, tendo sido amostradas apenas durante suas descrições (p. ex. há mais de 40 anos atrás). Muitas dessas espécies não são classificadas em nenhum nível de ameaça na lista vermelha de espécies ameaçadas da IUCN, principalmente devido à falta de informações sobre suas distribuições geográficas e biologia. Monitorar anfíbios raros associados à camada de serrapilheira é desafiador. Procurar por traços de DNA dessas espécies, que podem permanecer no ambiente (DNA ambiental ou eDNA), nos permitiria monitorar uma ampla área geográfica, em um curto período de tempo, sem a necessidade de observação direta dos indivíduos, aumentando assim nossa habilidade de monitorar esses anfíbios. No entanto, a análise de traços de DNA na serrapilheira é uma abordagem inovadora, nunca tendo sido aplicada para o monitoramento de anfíbios, necessitando, portanto, o desenvolvimento de protocolos específicos, especialmente para a amostragem e extração de DNA. Neste sentido, o objetivo deste estudo é testar e validar os protocolos para análise de DNA ambiental de serrapilheira em uma área onde a anurofauna é bastante conhecida. Esse conhecimento prévio nos dará suporte para testar a viabilidade da abordagem de metabarcodes para DNA ambiental para a detecção de anfíbios, e para acessar o desempenho do método em detectar tanto espécies raras como abundantes. Os métodos desenvolvidos neste estudo serão aplicados posteriormente no projeto para procurar por espécies de anfíbios não registradas há muitos anos na Mata Atlântica. (AU)