Varredura genômica ampla por loci afetados pela seleção recente em raças bovinas de corte, taurina e zebuína, através de medidas compostas

• Processo: 18/11460-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2019
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Humberto Tonhati
• Beneficiário: Diercles Francisco Cardoso
• Supervisor: Antonio Reverter-Gomez
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO), Austrália
• Vinculado à bolsa: 16/22490-8 - Mapeamento de assinaturas de seleção no genoma das principais espécies domésticas da tribo Bovini exploradas na pecuária, os bovinos (Bos taurus) e os bubalinos (Bubalus bubalis), BP.PD
• Assunto(s): Gado Nelore Gado Aberdeen-Angus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Angus | assinaturas de seleção | Características de Crescimento | Nelore | padrão racial | Genômica, genética de populações

Resumo

A combinação de diferentes metodologias estatísticas em uma medida composta, é sugerida como forma de melhorar o discernimento de verdadeiras assinaturas de seleção em dados genômicos populacionais. O presente projeto propõem a utilização a varredura por assinaturas de seleção no genoma de bovinos das raças Nelore e Angus, por meio do método composto intitulado 'de-correlated composite of multiple signals' (DCMS), que combina oito estatísticas distintas, com ponderações pela correlação entre elas, em um único valor. As estatísticas que compõem o DCMS incluem cinco abordagens intra-populacionais (D de Tajima, D* de Fu e Li, F* de Fu e Li, Composite Likelihood Ratio - "CLR" e integrated Haplotype Score - "iHS") e três abordagens inter-populacionais ( Índice de Fixação de Wright - "FST", Cross-Population Composite Likelihood Ratio - "XPCLR" e Cross-Population Extended Haplotype Homozygosity - "XPEHH"). A população analisada neste estudo se constituirá de aproximadamente 700 animais de cada raça, com informações genotípicas para aproximadamente 150K SNPs. Após identificação das assinaturas de seleção em cada raça, elas serão criteriosamente avaliadas quanto a sobreposição com QTL previamente conhecidos e funcionalidade de genes nelas mapeados. (AU)