| Processo: | 18/12461-6 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de fevereiro de 2019 |
| Data de Término da vigência: | 31 de março de 2022 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos |
| Pesquisador responsável: | José Freire da Silva Neto |
| Beneficiário: | Maristela Previato Mello |
| Instituição Sede: | Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Regulação da expressão gênica Análise de sequência de RNA Interações hospedeiro-patógeno |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Dual RNA-seq | fatores de transcrição da família MarR | Interação patógeno-hospedeiro | Regulação gênica | RNA-seq | virulencia bacteriana | Regulação Gênica |
Resumo Durante a infecção ocorre a modulação da expressão gênica tanto do patógeno quanto do hospedeiro. A bactéria Chromobacterium violaceum é um patógeno oportunista que causa graves infecções caracterizadas por quadros septicêmicos que podem levar a óbito. No entanto, não existem estudos caracterizando de maneira global as alterações na expressão gênica durante a interação patógeno-hospedeiro na infecção em mamíferos causada por C. violaceum. Assim, propomos identificar as alterações transcricionais globais durante a infecção por C. violaceum em culturas de células e em tecido animal in vivo usando sequenciamento de RNA (RNA-seq). Para isto, iremos caracterizar a infecção por C. violaceum em culturas celulares de hepatócitos e macrófagos utilizando microscopia eletrônica de transmissão. Em seguida, iremos sequenciar o RNA de C. violaceum durante a infecção em fígado, hepatócito e macrófago de camundongo, além de também sequenciar o RNA do macrófago infectado com esta bactéria, utilizando as técnicas de RNA-seq e Dual RNA-seq. Realizaremos uma análise global destes transcriptomas com enfoque na identificação dos genes para fatores de virulência e reguladores de transcrição, principalmente reguladores da família MarR, os quais já são alvos de estudos in vitro e com papel em virulência visto pelo nosso grupo. Os genes diferencialmente expressos selecionados serão validados por qRT-PCR e analisados para seu papel em virulência. Assim, os transcriptomas obtidos e analisados neste trabalho em condições infectantes deverão contribuir para a descoberta das redes regulatórias envolvidas na expressão in vivo de determinantes de virulência de C. violaceum e das vias de defesa do hospedeiro. | |
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