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Isolamento de proteínas do loci de rDNA através da dCas9 marcada em células tumorais estimuladas com FGF2

Processo: 19/17675-7
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2019
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2020
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica
Pesquisador responsável:Julia Pinheiro Chagas da Cunha
Beneficiário:Francisca Nathália de Luna Vitorino
Supervisor: Michael P. Washburn
Instituição Sede:Instituto Butantan. São Paulo , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Stowers Institute for Medical Research, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:17/18344-9 - Proteômica quantitativa da cromatina frente ao tratamento com FGF2: análise da regulação transcricional e associação de cdc42, BP.DD
Assunto(s):Proteômica   Purificação de proteínas   DNA ribossômico   Fator 2 de crescimento de fibroblastos   Cromatina
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:dCas9 | Fgf2 | Proteomics | rDNA | Transcription | Proteômica

Resumo

Apesar de ser um fator de crescimento, o FGF2 possui funções antiproliferativa e supressora de tumor em alguns contextos celulares. Na linhagem celular de adrenocarcinoma Y1, o FGF2 promove a transição G0-G1, mas atrasa a fase S e bloqueia permanentemente as células em G2/M. Para entender melhor a resposta da cromatina sob estímulos proliferativos e antiproliferativos induzidos, respectivamente, pelo soro bovino fetal (SFB) e FGF2, realizamos por proteômica quantitativa baseada em espectrometria de massas (Label-free) a análise das proteínas associadas à cromatina. Encontramos alterações na transcrição global (por ensaios de run-on), desorganização nucleolar (por imunofluorescência da fibrilarina e ensaios de microscopia eletrônica de transmissão), e pré-rRNA (por ensaios de Northern blot) após 1, 5 e 24 h após o tratamento com FGF2. O processamento e transcrição do rRNA são amplamente estudados, no entanto, devido a limitações técnicas, o conteúdo proteômico do locus de rDNA ainda não foi explorado. Aqui, propomos identificar as proteínas associadas a esses loci usando a técnica CLASP (Cas9 locus-associated proteome), uma tecnologia de ponta desenvolvida em colaboração com o grupo do Dr. Washburn. O conteúdo proteico identificado nos loci de rDNA será explorado no contexto do estímulo com FGF2 em uma linhagem celular de tumor de camundongo e em uma linhagem celular humana (Y1 e HEK293, respectivamente) expressando HRAS oncogênico induzível (HEK/ER:H-rasV12). Esses dados podem indicar mecanismos importantes mantidos no nucléolo pelo qual o FGF2 induz a parada do ciclo celular e também o proteoma inexplorado dos loci do rDNA, possivelmente identificando novos agentes da complexa biologia dos loci do nucléolo/rDNA. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
VITORINO, FRANCISCA N. DE LUNA; LEVY, MICHAELLA J.; WAILEMANN, ROSANGELA A. MANSANO; LOPES, MARIANA; SILVA, MARIANA LOTERIO; SARDIU, MIHAELA E.; GARCIA, BENJAMIN A.; MOTTA, MARIA CRISTINA MACHADO; OLIVEIRA, CARLA COLUMBANO; ARMELIN, HUGO AGUIRRE; et al. The antiproliferative effect of FGF2 in K-Ras-driven tumor cells involves modulation of rRNA and the nucleolus. Journal of Cell Science, v. 136, n. 22, p. 13-pg., . (17/18344-9, 11/22619-7, 13/07467-1, 17/06104-3, 18/15553-9, 19/17675-7)