Mapeamento de assinaturas epigenômicas associadas com mutação IDH

• Processo: 21/08190-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2022
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Tathiane Maistro Malta Pereira
• Beneficiário: Isabela Dias Erthal
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/00583-0 - Análise epigenômica integrativa de gliomas: definindo regiões regulatórias associadas ao stemness e ao fenótipo hipermetilador de tumores com mutações nos genes IDH1/2, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Epigênese genética Metilação de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: epigenética | isocitrato desidrogenase (IDH) | metilação de DNA | Bioinformática

Resumo

Este bolsista trabalhará na identificação de alterações epigenômicas em amostras de tumor que abrigam a mutação IDH1/ 2. Essa pessoa usará dados públicos e ferramentas de R/bioconductor de código aberto para mapear as alterações epigenéticas compartilhadas e/ou específicas do tecido associadas a mutações nos genes IDH1/2 em diferentes tipos de tumor. Este estudo contribuirá para desvendar os mecanismos que levam à desregulação da metilação global do DNA e suas implicações clínicas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LARISSA MIYUKI OKANO; LÍVIA MARIA MACIEL DA FONSECA; ISABELA DIAS ERTHAL; TATHIANE MAISTRO MALTA. Epigenomic integrative analysis pinpoint master regulator transcription factors associated with tumorigenesis in squamous cell carcinoma of oral tongue. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 46, n. 2, 2023-06-19. (19/14928-1, 18/00583-0, 21/08190-0)