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Mapeamento de assinaturas epigenômicas associadas com mutação IDH

Processo: 21/08190-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2021
Data de Término da vigência: 31 de julho de 2022
Área de conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Tathiane Maistro Malta Pereira
Beneficiário:Isabela Dias Erthal
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/00583-0 - Análise epigenômica integrativa de gliomas: definindo regiões regulatórias associadas ao stemness e ao fenótipo hipermetilador de tumores com mutações nos genes IDH1/2, AP.JP
Assunto(s):Biologia computacional   Epigênese genética   Metilação de DNA
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:epigenética | isocitrato desidrogenase (IDH) | metilação de DNA | Bioinformática

Resumo

Este bolsista trabalhará na identificação de alterações epigenômicas em amostras de tumor que abrigam a mutação IDH1/ 2. Essa pessoa usará dados públicos e ferramentas de R/bioconductor de código aberto para mapear as alterações epigenéticas compartilhadas e/ou específicas do tecido associadas a mutações nos genes IDH1/2 em diferentes tipos de tumor. Este estudo contribuirá para desvendar os mecanismos que levam à desregulação da metilação global do DNA e suas implicações clínicas. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LARISSA MIYUKI OKANO; LÍVIA MARIA MACIEL DA FONSECA; ISABELA DIAS ERTHAL; TATHIANE MAISTRO MALTA. Epigenomic integrative analysis pinpoint master regulator transcription factors associated with tumorigenesis in squamous cell carcinoma of oral tongue. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 46, n. 2, . (19/14928-1, 18/00583-0, 21/08190-0)