Busca por variantes genéticas com potencial patogênico em pacientes com fenótipo característico de coesinopatias com enfoque na Síndrome de Cornelia de Lange

• Processo: 22/03428-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2022
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2026
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Maria Isabel de Souza Aranha Melaragno
• Beneficiário: Beatriz de Carvalho Nunes
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/21644-0 - Impacto de variantes genéticas na estabilidade do genoma e seus efeitos no fenótipo, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/12833-9 - Aplicando next-generation phenotyping para priorizar pacientes com a Síndrome de Cornelia de Lange para exames adicionais e para melhorar a classificação de variantes, BE.EP.DD
• Assunto(s): Genética médica Etiologia Síndrome de Cornélia de Lange Mosaicismo Análise de sequência de DNA Sequenciamento completo do exoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Coesinopatias | mosaicismo | síndrome de Cornelia de Lange | variantes patogênicas | Genética Médica

Resumo

Coesinopatias é o nome dado a doenças causadas por mutações em genes que fazem parte do complexo proteico denominado de coesina ou de seus reguladores. Esse complexo tem diversas funções na atividade celular e manutenção da arquitetura genômica. Por se tratar de síndromes causadas por mutações que afetam a mesma estrutura, muitas vezes os fenótipos das coesinopatias se sobrepõem, dificultando o diagnóstico clínico sem uma investigação molecular. Outros fatores como variantes em mosaico no gene NIPBL, as quais não são identificadas em DNA obtido a partir do sangue periférico, e variantes em regiões não codificantes do genoma também contribuem para a dificuldade de diagnóstico clínico e molecular das coesinopatias. Sendo assim, este trabalho visa buscar novas variantes relacionadas a coesinopatias, em especial à Síndrome de Cornelia de Lange, por meio de sequenciamento de exoma utilizando amostra de mucosa oral, assim como variações no número de cópias (CNVs), a partir de SNP-array, e variantes em locais não codificantes do genoma, por meio de sequenciamento do genoma. Os resultados obtidos poderão sugerir novas regiões e variantes de interesse para o estudo e diagnóstico de coesinopatias, em especial da Síndrome de Cornelia de Lange, podendo assim ampliar o conhecimento dos fatores genéticos relacionado à patogênese das coesinopatias. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

NUNES, BEATRIZ CARVALHO; FAVILLA, BIANCA PEREIRA; VILELLA, THAINA; PINHEIRO, ISABEL; AOI, HAROMI; SEYAMA, RIE; MATSUMOTO, NAOMICHI; BELLUCCO, FERNANDA TEIXEIRA; KIM, CHONG; MELARAGNO, MARIA ISABEL. Buccal cell whole exome sequencing improves the diagnostic yield in a Cornelia de Lange Syndrome Brazilian cohort. European Journal of Human Genetics, v. 32, p. 2-pg., 2024-01-01. (19/21644-0, 22/03428-0)

NUNES, BEATRIZ CARVALHO; VILELLA, THAINA; PINHEIRO, ISABEL; AOI, HIROMI; SEYAMA, RIE; MATSUMOTO, NAOMICHI; BELLUCCO, FERNANDA TEIXEIRA; KIM, CHONG; MELARAGNO, MARIA ISABEL; KRAWITZ, PETER; et al. Next-generation phenotyping improves the diagnostic yield in a Cornelia de Lange Syndrome Brazilian cohort. European Journal of Human Genetics, v. 32, p. 2-pg., 2024-12-01. (19/21644-0)