Ampliação dos serviços de sequenciamento NGS oferecidos pela facility multiusuário FAPESP/USP do Centro de Estudo do Genoma Humano e Células-Tronco (CEGH-CEL).

• Processo: 24/05832-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2024
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Maria Rita dos Santos e Passos Bueno
• Beneficiário: Monica Castro Varela Rodrigues da Silva
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/08028-1 - CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco, AP.CEPID
• Assunto(s): Análise de sequência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Interpretação de variantes germinativas de Exoma Humano (WES) | RNAseq | Sequenciamento de Nova Geração (NGS) | Sequenciamento massivo paralelo | Wgs | Bióloga

Resumo

O Centro de Estudos do Genoma Humano e Células-tronco (CEGH-CEL) tem como um dos principais propósitos da área de transferência de tecnologia a prestação de serviços de sequenciamento de exomas completos (WES) humanos, além de genomas (WGS) e transcriptomas (RNAseq) de qualquer espécie para pesquisadores da USP e de outras universidades. A facility de sequenciamento de Nova Geração (NGS) que foi criada logo após a aquisição do HiSeq2500 pelo Programa Equipamentos Multiusuários (EMU) processo Fapesp 14/50148-7, teve seu potencial de sequenciamento ampliado no ano de 2020, com a aquisição da plataforma NovaSeq6000 e hoje faz parte da Central Multiusuários-USP (https://uspmulti.prp.usp.br/public/centrais/11). Dada a grande capacidade do sequenciador NovaSeq6000, por meio desta proposta temos como objetivo desenvolver estratégias para aumentar a demanda e diversificação dos serviços prestados pela facility. Neste sentido, as principais atividades a serem desempenhadas pela bolsista serão: (a) trabalhar na divulgação do serviço, ampliando a visibilidade do CEGH-CEL, visando o atendimento a um número maior de pesquisadores de todo o Brasil; (b) aumentar a utilização flow-cells de grande porte, tendo como objetivo final a redução dos custos por amostra, tornando nossos preços competitivos com os praticados internacionalmente; (c) disponibilizar serviço de análise e interpretação de dados de painéis customizados ou WES humanos a pesquisadores externos, bem como oferecer consultoria para os que tenham interesse em implementar esse tipo de análise em seus grupos de pesquisa; d) estruturar e ministrar, junto com a equipe de especialistas do CEGH-CEL, um curso de introdução à análise genômica, abordando tópicos de interesse para a interpretação de variantes germinativas.