Explorando o relevo de energia de enovelamento da leptina: uma proteína de topologia de laço perfurado

• Processo: 24/21775-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2026
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Vitor Barbanti Pereira Leite
• Beneficiário: Vicente Christiano Filho
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 22/07231-7 - Plasticidade e modulação funcional de proteínas intrinsecamente desordenadas, AP.TEM
• Assunto(s): Dobramento de proteína Leptina
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Enovelamento de proteínas | Leptina | nó topológico | Modelagem Molecular e Simulações Computacionais

Resumo

A teoria de relevo de energia (energy landscapes) tem contribuído significativamente para o entendimento de sistemas moleculares complexos, tais como o problema do enovelamento de proteína. Este projeto será focado no estudo do relevo de energia de proteínas utilizando modelos computacionais simplificados (coarse-grained models) e abordagens de física estatística. A ideia central está relacionada à visualização da superfície de energia utilizando o Energy Landscape Visualization Method (ELViM). O ELViM foi concebido para visualização do funil de enovelamento de proteínas e apresenta grande potencial de detalhamento de mecanismos moleculares por ir além da representação unidimensional. Em particular, aplicaremos esta metodologia à leptina, uma proteína que apresenta uma condição em sua estrutura nativa conhecida como Pierced Lasso Topology (PLT). O estudo desta proteína com enovelamento singular ajudará a investigar os limites de aplicabilidade do ELViM.