AVALIAÇÃO DA EXATIDÃO DO MÉTODO DE ARRAY PARA ANÁLISE DE COPY NUMBER VARIATIONS (CNVs) DO GENE CYP2D6

• Processo: 25/07105-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2026
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia
• Pesquisador responsável: Carolina Dagli Hernandez
• Beneficiário: Alice Cordeiro dos Santos Correia
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Farmacogenética Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR)
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: array | Cyp2D6 | Farmacogenética | qPCR | Variações No Número De Cópias | farmacogenética

Resumo

Introdução: O gene CYP2D6 codifica uma enzima do citocromo P450 responsável pelo metabolismo de cerca de 20% dos fármacos clinicamente utilizados, incluindo antineoplásicos e opioides. Variações genéticas nesse gene influenciam no fenótipo metabólico, podendo classificar os indivíduos em metabolizadores lentos, intermediários, normais ou ultrarrápidos. A análise de variações no número de cópias (CNVs) do gene CYP2D6 é especialmente importante para a identificação de metabolizadores ultrarrápidos e de alelos híbridos não funcionais do gene CYP2D6 e seu pseudogene vizinho, CYP2D7. A caracterização precisa das CNVs é importante para a implementação da farmacogenética na prática clínica. Entres os métodos de genotipagem disponíveis, a genotipagem por array apresenta potencial para detectar CNVs e híbridos, mas ainda requerem validação frente a metodologias consolidadas, como a reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR).Objetivo: Avaliar a exatidão da técnica de genotipagem por array para detecção de CNVs em CYP2D6. Material e Métodos: Serão incluídos pacientes com CNVs ou alelos híbridos em CYP2D6, previamente identificados por array, oriundos de estudos do laboratório CliPhar (UNICAMP). A extração de DNA foi realizada a partir de sangue total ou esfregaço de bochecha. A genotipagem por array foi conduzida com o kit Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx. Já a genotipagem por qPCR será realizada com sondas TaqMan específicas para as regiões 5'-UTR e exon 9 da CYP2D6. Os dados obtidos por ambas as técnicas serão comparados por meio da análise de concordância, utilizando o coeficiente kappa de Cohen para variáveis categóricas e a correlação intraclasse para medidas contínuas. O estudo foi aprovado pelos Comitês de Ética em Pesquisa da UNICAMP e do INCA. (AU)